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華為云醫(yī)療智能體喬楠: 基于EIHealth平臺(tái)的抗疫全景解讀

本文作者: 李雨晨 2020-07-13 20:49
導(dǎo)語(yǔ):EIHealth主要覆蓋基因組,臨床研究和藥物研發(fā)三個(gè)方向。

雷鋒網(wǎng)消息,7月10-11日,2020世界人工智能健康云峰會(huì)召開(kāi)。作為世界人工智能大會(huì)云端峰會(huì)的主題論壇之一,健康云峰會(huì)以“智聯(lián)世界·共享健康”為主題,由“1個(gè)開(kāi)幕式+3場(chǎng)專題論壇+1場(chǎng)特色會(huì)議”構(gòu)成,聚焦“AI+健康”“AI+公共衛(wèi)生”“AI+醫(yī)療服務(wù)”“AI+生物醫(yī)藥”“AI+醫(yī)療標(biāo)準(zhǔn)規(guī)范”等熱點(diǎn)話題。

在“AI+醫(yī)療服務(wù)”專場(chǎng)上,華為技術(shù)有限公司云醫(yī)療智能體喬楠博士發(fā)表了主題為《華為云EIHealth 科技抗疫 共克時(shí)艱》的主題演講。

華為云醫(yī)療智能體喬楠: 基于EIHealth平臺(tái)的抗疫全景解讀

喬楠表示,在醫(yī)療行業(yè),華為云的EIHealth平臺(tái)致力于打造醫(yī)療行業(yè)人工智能的“黑土地”,支撐生物技術(shù)公司、醫(yī)院、制藥公司等進(jìn)行AI和數(shù)字化轉(zhuǎn)型,突入行業(yè)的深水區(qū),找到業(yè)務(wù)發(fā)展的第二曲線。他還講到,目前,EIHealth主要覆蓋基因組、臨床研究和藥物研發(fā)三個(gè)方向。

在此次抗擊新冠肺炎的戰(zhàn)斗中,EIHealth在以上三個(gè)領(lǐng)域取得了諸多成果,多方面助力抗疫,實(shí)現(xiàn)了平臺(tái)自身價(jià)值的最大化。

例如,在武漢,武漢希望組和華為組成聯(lián)合團(tuán)隊(duì),在無(wú)固定IT基礎(chǔ)設(shè)施的臨時(shí)醫(yī)院,實(shí)現(xiàn)并驗(yàn)證了基于三代測(cè)序技術(shù)的新冠病毒快速基因檢測(cè)技術(shù)。

在廣東,華為云EI團(tuán)隊(duì)協(xié)助廣東省再生實(shí)驗(yàn)室,加速新冠肺炎影像AI模型開(kāi)發(fā),完成新冠肺炎影像AI模型訓(xùn)練,并且聯(lián)合華中科技大學(xué)、藍(lán)網(wǎng)科技共同推出AI輔助醫(yī)療影像篩查服務(wù)。服務(wù)整合了華為云端的AI+CT推理服務(wù),可以直接給到醫(yī)院供臨床醫(yī)生使用。

以下為喬楠的演講內(nèi)容,雷鋒網(wǎng)作了不改變?cè)獾木庉嫾罢恚?/strong>

喬楠:大家下午好,非常感謝世界人工智能大會(huì)組委會(huì)的邀請(qǐng),也很榮幸參加這次“智聯(lián)世界 共享健康”上海云峰會(huì)。

今天我要給大家介紹的是華為云的EIHealth平臺(tái)。在這次抗疫中,EIHealth推出了一系列的抗疫黑科技,支撐國(guó)內(nèi)外高校、研究機(jī)構(gòu)、醫(yī)療和合作伙伴,一起利用科技抗疫、共克時(shí)艱。

華為聚焦于ICT技術(shù),也就是信息與通信技術(shù),面向消費(fèi)者、運(yùn)營(yíng)商和企業(yè)三類客戶群,提供創(chuàng)新的端到端的ICT解決方案和產(chǎn)品,包括智能終端和可穿戴式設(shè)備,各種網(wǎng)絡(luò)互連設(shè)備,以及云計(jì)算。

消費(fèi)者業(yè)務(wù)、運(yùn)營(yíng)商業(yè)務(wù)、企業(yè)業(yè)務(wù)和云業(yè)務(wù)是華為的核心四大業(yè)務(wù)領(lǐng)域。

華為每年在持續(xù)創(chuàng)新和自主研發(fā)上投入大量的人力和資源,2019年研發(fā)總投入1317億元,研發(fā)人員遍布全球的14個(gè)研究所和36個(gè)聯(lián)合創(chuàng)新中心。

華為現(xiàn)有3000多名AI專家,發(fā)表了200多篇AI文章,持有600多項(xiàng)AI專利,這些數(shù)字每天都在持續(xù)增加中。

2018年,徐直軍總裁正式對(duì)外宣布了華為的全棧、全場(chǎng)景AI戰(zhàn)略;2019年,胡厚崑總裁正式宣布華為的全站全場(chǎng)景AI戰(zhàn)略已經(jīng)落地,我們推出了最強(qiáng)的AI推理芯片昇騰310,AI訓(xùn)練芯片昇騰910,以及通用計(jì)算的鯤鵬芯片。

我們?cè)?020年的華為開(kāi)發(fā)者大會(huì)上開(kāi)源了可以媲美TensorFlow和Pytorch的MindSpore深度學(xué)習(xí)框架;而華為的一站式AI平臺(tái)ModelArts,在正式發(fā)布一年后,也推出了面向企業(yè)客戶的專業(yè)版。

針對(duì)企業(yè)客戶,我們不僅提供了通用的AI、API,如圖像識(shí)別,文本識(shí)別,也提供了面向軟件工程師的高級(jí)API,方便企業(yè)客戶的集成和應(yīng)用,針對(duì)城市、互聯(lián)網(wǎng)、園區(qū)、醫(yī)療等行業(yè),我們進(jìn)一步推出了EI智能體解決方案。

所有這些共同組成了華為云企業(yè)智能EI服務(wù),打造人工智能的黑土地,使華為云成為企業(yè)智能化數(shù)字轉(zhuǎn)型的最佳合作伙伴。

華為云企業(yè)智能面向醫(yī)療行業(yè)推出的是EIHealth平臺(tái)。

近些年來(lái),AI在醫(yī)療領(lǐng)域的研究和應(yīng)用非?;钴S,我們希望通過(guò)EIHealth為醫(yī)療客戶提供一個(gè)端到端的AI研發(fā)平臺(tái),從而加速AI的研究、AI知識(shí)資產(chǎn)的積累、AI成果的轉(zhuǎn)換應(yīng)用。

更進(jìn)一步的,推動(dòng)AI的民主化。通過(guò)AutoML自動(dòng)建模技術(shù),讓每一個(gè)人都可以利用AI解決工作中遇到的問(wèn)題。

EIHealth當(dāng)前主要覆蓋三個(gè)方向:基因組、臨床研究和藥物研發(fā)。

華為云醫(yī)療智能體喬楠: 基于EIHealth平臺(tái)的抗疫全景解讀

在今年一月份疫期爆發(fā)初期,EIHealth團(tuán)隊(duì)就投入到緊張的抗疫研發(fā)第一線,我們和國(guó)內(nèi)的高校,研究機(jī)構(gòu)以及合作伙伴一起,在基因組、臨床研究和藥物研發(fā)等多個(gè)領(lǐng)域取得了一系列的合作成果,并且在第一時(shí)間公開(kāi)和公布了這些研究成果,為抗疫研究爭(zhēng)取了寶貴的時(shí)間。

為了更好的支持抗疫研發(fā),EIHealth通過(guò)整合華為2012實(shí)驗(yàn)室多年的研究成果,迅速研發(fā)并上線了一系列抗疫科技,在國(guó)內(nèi)外的抗疫工作中發(fā)揮了巨大的價(jià)值。

華為云醫(yī)療智能體喬楠: 基于EIHealth平臺(tái)的抗疫全景解讀

對(duì)于一種新型病毒,研究人員首先要做的是對(duì)該病毒的基因和蛋白進(jìn)行深入的研究,接下來(lái)需要針對(duì)病毒研發(fā)檢測(cè)技術(shù)。最后,研究人員需要針對(duì)病毒研發(fā)藥物和抗體,這樣才能徹底打敗病毒。

EIHealth 抗病毒服務(wù)提供了覆蓋病毒研究、病毒檢測(cè)和抗病毒藥物研發(fā)者三個(gè)階段的多種功能,如病毒基因組研究、病毒進(jìn)化研究、病毒蛋白結(jié)構(gòu)研究、新冠肺炎AI+CT檢測(cè)、抗病毒藥物篩選和新冠AI圖譜,這些功能可以極大加速病毒的研究和抗疫新技術(shù)的研發(fā)。

在基因組領(lǐng)域,EIHealth提供了全面的工具和流程,覆蓋了二代測(cè)序和三代測(cè)序技術(shù),使得研究人員可以快速進(jìn)行病毒序列的檢測(cè)、病毒基因組的組裝、病毒突變的識(shí)別和病毒的進(jìn)化分析。所有的這一切都可以在華為云端,利用華為云的強(qiáng)大算力迅速完成。

這里演示的是EIHealth平臺(tái)的病毒基因檢測(cè)流程,該流程通過(guò)分析病人的基因測(cè)序數(shù)據(jù),可以快速準(zhǔn)確的識(shí)別出新冠病毒的基因序列,從而可以作為傳統(tǒng)病毒檢測(cè)技術(shù)的有效補(bǔ)充。

通過(guò)華為5G技術(shù)、華為云的鯤鵬芯片和昇騰芯片,我們將數(shù)小時(shí)的分析任務(wù)加速到了十分鐘以內(nèi),極大的提高了病毒檢測(cè)的效率。

在臨床研究領(lǐng)域,EIHealth研發(fā)了多個(gè)AI模型,用于對(duì)新冠肺炎的病灶分割和定量分析,對(duì)肺病病灶的3D重建,以及對(duì)病情演化的對(duì)比分析,這些AI模型的應(yīng)用極大的提升了臨床醫(yī)生閱片的效率。

這里演示的是EIHealth平臺(tái)的AI輔助新冠肺炎篩查服務(wù),該模型可以達(dá)到99%的敏感度和90%的精度。針對(duì)肺病病變的DICE系數(shù)可以達(dá)到0.82,AI輔助新冠肺炎篩查同樣可以作為傳統(tǒng)病毒檢測(cè)技術(shù)的有效補(bǔ)充,對(duì)病人的診斷結(jié)果進(jìn)行交叉驗(yàn)證,提高診斷的準(zhǔn)確性。

通過(guò)華為昇騰AI芯片的加速,我們將AI模型的推理時(shí)間壓縮到數(shù)秒內(nèi)完成。

EIHealth團(tuán)隊(duì)在一月底和中科院、華中科大以及西安交大的數(shù)位教授和博士共同啟動(dòng)了神農(nóng)項(xiàng)目。

該項(xiàng)目在一周內(nèi),利用華為云的鯤鵬集群和昇騰集群的算力,針對(duì)21個(gè)病毒靶點(diǎn)以及8506個(gè)臨床藥物進(jìn)行了虛擬篩選,并且將虛擬篩選的結(jié)果通過(guò)神農(nóng)項(xiàng)目網(wǎng)站,面向全球進(jìn)行公布。

這也是迄今為止全球最大的、完全免費(fèi)公開(kāi)的新冠藥物虛擬篩選數(shù)據(jù)庫(kù)。研究人員和臨床醫(yī)生可以在神農(nóng)項(xiàng)目網(wǎng)站上對(duì)病毒蛋白和藥物進(jìn)行查詢,并能夠以3D可視化的形式展示病毒蛋白和藥物的結(jié)合位點(diǎn)。

這里演示的是支撐神農(nóng)項(xiàng)目背的抗病毒藥物虛擬篩選服務(wù),研究人員可以利用該服務(wù),針對(duì)自己設(shè)計(jì)的病毒靶點(diǎn)和小分子藥物數(shù)據(jù)庫(kù),進(jìn)行超大規(guī)模的藥物虛擬篩選。

借助華為鯤鵬芯片和昇騰芯片的超強(qiáng)算力,我們可以將原本需要一個(gè)月的計(jì)算任務(wù)加速到幾個(gè)小時(shí)內(nèi)完成。

由于新冠病毒是一種全新的病毒,對(duì)新冠病毒的研究在短短幾個(gè)月的時(shí)間里就積累了上萬(wàn)篇文獻(xiàn),如何能夠從文獻(xiàn)中提取準(zhǔn)確有效的知識(shí),從而啟發(fā)新的研究思路,并且避免重復(fù)性研究,已經(jīng)成為研究人員面臨的最大問(wèn)題。

通過(guò)利用華為云的知識(shí)圖譜服務(wù)和2012實(shí)驗(yàn)室發(fā)表的BERT-MK醫(yī)療預(yù)訓(xùn)練模型,EIHealth迅速推出了新冠科研AI圖譜。

利用新冠科研AI圖譜,研究人員可以對(duì)自己感興趣的目標(biāo)進(jìn)行搜索,這里我們可以針對(duì)病毒的蛋白進(jìn)行搜索,如Spike蛋白,搜索可以得到Spike蛋白的靶向蛋白,針對(duì)Spike蛋白的藥物或者抗體,這些信息所在的文獻(xiàn)段落及文獻(xiàn)鏈接會(huì)顯示在知識(shí)圖譜的下方;

同樣,我們可以搜索感興趣的藥物,如奈非那韋。最近有多篇文獻(xiàn)報(bào)道它可以抑制新冠病毒,通過(guò)知識(shí)圖譜查詢,我們可以看到奈非那韋的靶點(diǎn)蛋白是病毒的Mpro蛋白。

現(xiàn)在是技術(shù)創(chuàng)新的大時(shí)代,也是中國(guó)的企業(yè)往深水區(qū)邁進(jìn)的關(guān)鍵階段,如何能夠加速科技創(chuàng)新及應(yīng)用,已經(jīng)是各行業(yè)領(lǐng)頭羊能夠存活下去的關(guān)鍵因素。

在短短的幾個(gè)月里,我們不僅通過(guò)EIHealth平臺(tái)研發(fā)出了一系列黑科技,同時(shí)也和合作伙伴一起推動(dòng)了這些技術(shù)的落地和應(yīng)用,接下來(lái)我會(huì)為大家介紹最近我們?nèi)〉玫暮献鞒晒?/p>

1月30號(hào),武漢希望組和華為組成聯(lián)合團(tuán)隊(duì),在無(wú)固定IT基礎(chǔ)設(shè)施的臨時(shí)醫(yī)院,實(shí)現(xiàn)并驗(yàn)證了基于三代測(cè)序技術(shù)的新冠病毒快速基因檢測(cè)技術(shù)。

當(dāng)測(cè)序儀產(chǎn)生數(shù)據(jù)后,基因數(shù)據(jù)通過(guò)5G網(wǎng)絡(luò)傳輸給華為云,然后利用華為云服務(wù)與AI技術(shù),快速分析得到病毒檢測(cè)結(jié)果。該技術(shù)在抗疫初期發(fā)揮了重要的作用。

2月10日,在華為云技術(shù)團(tuán)隊(duì)的支持下,中國(guó)科學(xué)院上海營(yíng)養(yǎng)與健康研究所和上海巴斯德所,正式上線了新冠病毒基因自動(dòng)化鑒定云平臺(tái),并在疫情期間免費(fèi)開(kāi)放。

該平臺(tái)為新冠基因組分析提供了一鍵式自動(dòng)化服務(wù),為新冠病毒臨床診斷,病毒變異趨勢(shì)監(jiān)控提供了重要的依據(jù)。還在上海市公共衛(wèi)生臨床中心,瑞金醫(yī)院及多家醫(yī)療機(jī)構(gòu)的患者基因數(shù)據(jù)分析中得到了廣泛的使用。

2月2號(hào),為了支持廣東省再生實(shí)驗(yàn)室新冠肺炎影像AI模型的訓(xùn)練,華為云緊急調(diào)度了一批AI訓(xùn)練服務(wù)器,確保了再生實(shí)驗(yàn)室研究任務(wù)的順利完成。

2月8號(hào),華為云和華中科技大學(xué),藍(lán)網(wǎng)科技共同研發(fā)的AI輔助醫(yī)療影像篩查服務(wù)正式上線,該服務(wù)整合了華為云端的AI、 CT推理服務(wù),并可以直接部署到醫(yī)院供臨床醫(yī)生使用。

4月2號(hào),隨著華為云全球抗疫行動(dòng)的全面展開(kāi),在合作伙伴藍(lán)網(wǎng)科技、心醫(yī)國(guó)際和東軟集團(tuán)的共同努力下,EIHealth服務(wù)已經(jīng)進(jìn)入全球100余家醫(yī)院。

從2月1號(hào)開(kāi)始,由華為和中科院北京基因組研究所、華中科大、西安交大多名教授和博士組成的聯(lián)合科研團(tuán)隊(duì)陸續(xù)發(fā)布了一系列的成果,其中包括新冠病毒所有關(guān)鍵蛋白的同源模建結(jié)構(gòu),針對(duì)Mpro蛋白藥物篩選找到五個(gè)可能有效的藥物,其中有兩個(gè)藥物已經(jīng)進(jìn)入了臨床實(shí)驗(yàn)。

在4月2號(hào),聯(lián)合團(tuán)隊(duì)將這次大規(guī)??剐鹿谒幬锖Y選的所有數(shù)據(jù),發(fā)布到了神農(nóng)項(xiàng)目網(wǎng)站上,迄今為止,神農(nóng)項(xiàng)目已有755次國(guó)內(nèi)外訪問(wèn),并且有多篇基于神農(nóng)項(xiàng)目的科研成果也陸續(xù)發(fā)表了出來(lái)。

從2月10日開(kāi)始,華為聯(lián)合浙江大學(xué)發(fā)布了多個(gè)新冠科研AI知識(shí)圖譜,該AI圖譜采用了華為2012實(shí)驗(yàn)室和華為云最新研究成果,領(lǐng)先的醫(yī)學(xué)領(lǐng)域知識(shí)監(jiān)督預(yù)訓(xùn)練語(yǔ)言模型:BERT-MK,并融合了團(tuán)隊(duì)在知識(shí)挖掘領(lǐng)域積累的多項(xiàng)深度語(yǔ)義表示和檢索技術(shù)。

新冠科研AI知識(shí)圖譜通過(guò)OpenKG面向全球公開(kāi)訪問(wèn),迄今為止,已有超過(guò)1800次下載量。

華為云當(dāng)前在中國(guó)公有云市場(chǎng)排名第三,全球排名第六,華為云也是全球唯一一個(gè)具有全棧全場(chǎng)景AI能力的云廠商,這些都為國(guó)家新基建的落地提供了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。

今天我給大家的分享就到這里,希望能對(duì)大家有所幫助,謝謝大家!雷鋒網(wǎng)

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