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| 本文作者： 任平 | 2023-05-15 11:41 |
與許多傳統(tǒng)學(xué)科“尖深慢”不同，生物信息是“廣淺快”。
作為這個(gè)領(lǐng)域的華人開拓者，張奇?zhèn)ピ趪?guó)內(nèi)外享有盛名，早在2002年成為冷泉港實(shí)驗(yàn)室首位取得正教授職位的華人學(xué)者。但國(guó)內(nèi)很多人只熟悉“Michael Zhang”，并不熟悉中文名。
早期生物信息大牛Webb Miller曾跟他開玩笑，“Michael不要發(fā)那么多文章，讓我們大家都很難看”。同事們通常把張奇?zhèn)シQ為“百科全書”，向他請(qǐng)教各種問題，甚至在張奇?zhèn)ピO(shè)計(jì)生物實(shí)驗(yàn)時(shí)，連實(shí)驗(yàn)學(xué)家都驚嘆他對(duì)生物了解之深，完全看不出他是理論出身。
華盛頓大學(xué)數(shù)學(xué)系組織的一次研討課上，邀請(qǐng)張奇?zhèn)サ臄?shù)學(xué)系主任Spencer T. Olin吃驚道，張奇?zhèn)ヅc他們討論的是最前沿的純數(shù)學(xué)問題(如討論Kerov的書“無限維對(duì)稱群表示理論及其在數(shù)學(xué)分析中的應(yīng)用”)。
但在四十多年前，擺在張奇?zhèn)ッ媲暗囊坏离y題卻是失去讀書的機(jī)會(huì)。和那個(gè)年代的諸多知識(shí)青年一樣，留守農(nóng)村，接受貧下中農(nóng)再教育，將他們引向人生的轉(zhuǎn)折點(diǎn)。
少年期的他，因?yàn)楦改腹ぷ髟颍蝗藫?dān)負(fù)起弟弟妹妹的生活起居，本當(dāng)讀書的年紀(jì)也因?yàn)榉磸?fù)的停課復(fù)課頗有欠缺之處，要么課本已被砍到學(xué)不到什么東西，要么只得經(jīng)常課外請(qǐng)教被打倒的老教師，或者干脆拎起書本自學(xué)。
正如清華李衍達(dá)院士近年來總結(jié)，“張奇?zhèn)サ淖畲筇攸c(diǎn)，是總能提前感知和引領(lǐng)生物信息發(fā)展的下一個(gè)高潮”，最善于把最復(fù)雜難懂的東西，用最通俗易懂的方式講解出來，深入淺出，功底深厚”。
在風(fēng)起云涌的80年代，一個(gè)前所未有的機(jī)會(huì)落在了張奇?zhèn)ド砩稀?/p>
時(shí)任全國(guó)青年聯(lián)合會(huì)主席的胡啟立，計(jì)劃在團(tuán)中央籌辦一個(gè)大學(xué)部，以便與愈來愈多的國(guó)際間大學(xué)往來聯(lián)絡(luò)。團(tuán)委書記遠(yuǎn)澤清找到張奇?zhèn)?，希望他放棄出?guó)，調(diào)到團(tuán)中央出任第一任大學(xué)部部長(zhǎng)。在請(qǐng)教了三位中科大的副校長(zhǎng)之后，他放棄了學(xué)而優(yōu)則仕的坦途。
1981年，張奇?zhèn)ヌど狭孙w往紐約的飛機(jī)。他及百名中國(guó)學(xué)子，即將在歷史上寫下重要一筆。
1977年，恢復(fù)高考。12月10日，570萬考生走進(jìn)考場(chǎng)，成為書寫中國(guó)教育事業(yè)風(fēng)云變遷的重要一批人。
與過去的招生慣例不同，這是我國(guó)教育史上唯一一次冬季高考，也是年齡懸殊最大的一屆考試。
從1966年至1977年，絕大多數(shù)城鎮(zhèn)戶口的初中或高中畢業(yè)生只能“上山下鄉(xiāng)”、“接受貧下中農(nóng)再教育”，而農(nóng)村戶口的則回鄉(xiāng)務(wù)農(nóng)。當(dāng)國(guó)家一決定恢復(fù)高考，成千上萬的人重新拿起書本，有資格報(bào)考的人蜂擁而至，甚至不少父子、母女、兄弟、姐妹、師生攜手參加考試。
三年前，這是被分配村里做知青的張奇?zhèn)プ鰤?mèng)都在企盼的事情。
1974年，張奇?zhèn)ジ咧挟厴I(yè)，被分配到京郊懷柔縣城關(guān)公社劉各長(zhǎng)村做知青隊(duì)長(zhǎng)，開始了三年艱苦的插隊(duì)生活。和當(dāng)年廣大熱血青年一樣，他并不能理解為什么上大學(xué)的機(jī)會(huì)被剝奪。粉粹“四人幫”、鄧小平復(fù)出后，廣大年輕人盼望已久的高考恢復(fù)，插隊(duì)知青陸續(xù)招工回城。
時(shí)間有限，恢復(fù)高考的消息在1977年10月21日才登報(bào)，離開考期只有一個(gè)多月。從前途著想，張奇?zhèn)プ龅牡谝粋€(gè)選擇——留在村里，看場(chǎng)院，利用晚上時(shí)間緊張復(fù)習(xí)。
“身居鄉(xiāng)村小茅屋，心懷四化大目標(biāo)”，成為張奇?zhèn)サ恼鎸?shí)寫照。
在這道跨越“穿草鞋”與“穿皮鞋”的分水嶺上，21歲的張奇?zhèn)ジ叻挚既胫袊?guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)近代力學(xué)系。
與應(yīng)屆學(xué)生相比，張奇?zhèn)ツ挲g稍大成熟，選擇什么學(xué)校、學(xué)什么專業(yè)都有了自己的打算。
他講到，“我的擇校標(biāo)準(zhǔn)只有一條，離開北京，不要在家門口上學(xué)，不再受父母管教。至于專業(yè)，那個(gè)年代錢學(xué)森是小學(xué)校友、大眾偶像，當(dāng)時(shí)最大的心愿進(jìn)入飛行器力學(xué)專業(yè)學(xué)習(xí)航天器設(shè)計(jì)，畢業(yè)后成為一名火箭科學(xué)家?！?978年開春，張奇?zhèn)プ鳛楦呖蓟謴?fù)后的第一代大學(xué)生來到合肥。
1978年，中科大77-78屆校學(xué)生會(huì)干部留影，團(tuán)委書記遠(yuǎn)澤清（桌角），學(xué)生會(huì)主席張奇?zhèn)ィㄕ咀澜牵?/span>
作為中科院所建設(shè)的唯一一所大學(xué)，彼時(shí)的中科大的重要任務(wù)是為我國(guó)培養(yǎng)尖端科學(xué)研究技術(shù)干部。教育恢復(fù)后，該校匯集了各所著名研究員任教。
近代力學(xué)系機(jī)械更是由“中國(guó)航天事業(yè)奠基人”錢學(xué)森于1958年親自創(chuàng)建，并任首屆系主任。在錢學(xué)森的帶領(lǐng)下，同時(shí)代精銳全體出動(dòng)。如吳文俊教“高等數(shù)學(xué)”、嚴(yán)濟(jì)慈、錢臨照教“普通物理”、沈志榮教“固體力學(xué)”、龔升教“數(shù)學(xué)力學(xué)”、吳杭生教“統(tǒng)計(jì)力學(xué)”、溫元?jiǎng)P教“化學(xué)”、方勵(lì)之副校長(zhǎng)教“天體力學(xué)”。
錢學(xué)森對(duì)學(xué)生鼓舞道：“我把科學(xué)院的‘大炮’都給你們請(qǐng)來了！”
當(dāng)時(shí)的中科大因?yàn)閼?zhàn)備疏散原因搬遷至合肥，盡管遠(yuǎn)離中央，但一切工作都是“保住中國(guó)的科技苗子”。為了實(shí)現(xiàn)行政權(quán)力和學(xué)術(shù)權(quán)力的均衡，學(xué)校特意成立了一些委員會(huì)，比如學(xué)術(shù)委員會(huì)、學(xué)位委員會(huì)、專業(yè)技術(shù)職務(wù)評(píng)審委員會(huì)。此外，不僅老師要民主，學(xué)生也被鼓勵(lì)通過網(wǎng)絡(luò)、調(diào)研、座談等形式發(fā)表意見。
原中科大校黨委副書記、副校長(zhǎng)李定帶頭定調(diào)，“官本位在中科大是沒有市場(chǎng)的，任何創(chuàng)新都源于思想自由?！?/p>
這也證明，盡管那時(shí)候中國(guó)剛剛步入改革開放元年，但中科大學(xué)生身上的批判和實(shí)踐思維卻讓人記憶猶新。
在張奇?zhèn)ゴ差^，幾本康德或黑格爾的英文原著被翻得起皺。從寢室同學(xué)的視角看上去，張奇?zhèn)ケ砻嫔掀届o無波，并且一成不變，“靜靜閱讀，堅(jiān)持筆記”。
但張奇?zhèn)ワ@然不是一個(gè)只顧埋頭看書的人，入學(xué)后他當(dāng)選1977屆校學(xué)生會(huì)主席，很快便發(fā)起諸多英文學(xué)習(xí)和文體活動(dòng)。成立“美國(guó)之音”英語900句學(xué)習(xí)小組、教唱“音樂之聲”電影中的英文插曲、邀請(qǐng)外教每天早晨廣播英語教程。
關(guān)于此，中科大77、78級(jí)同學(xué)的書信和報(bào)道中都有記載，飯后在‘四牌樓’外讀英文蔚然成風(fēng)。”此外，張奇?zhèn)ズ臀乃嚥客瑢W(xué)組織全校大型交際舞會(huì)，邀請(qǐng)安徽醫(yī)學(xué)院、安徽大學(xué)、藝術(shù)學(xué)院女生來幫助活躍中科大學(xué)生們的業(yè)余生活。張奇?zhèn)サ耐嗤瑢W(xué)湯超、徐沖（班里文體委員），因?yàn)槲杼冒?，每次都是明星參加者?/p>
1979年中科大775班留影：徐沖（文體委員），湯超（學(xué)習(xí)委員），張奇?zhèn)ィ▽W(xué)生會(huì)主席），張執(zhí)戈（班長(zhǎng)）
有意思的是， 作為校學(xué)生會(huì)主席，張奇?zhèn)ヒ矝]少因?yàn)榫S護(hù)學(xué)生利益和校領(lǐng)導(dǎo)談判。
印象最深的一次，方毅任中科大副總理兼科學(xué)院院長(zhǎng)，并接任郭沫若擔(dān)任名義校長(zhǎng)，在征求學(xué)生生活意見的座談會(huì)上，張奇?zhèn)プ鳛閷W(xué)生代表大量申述學(xué)校在伙食、衛(wèi)生、取暖、供水、買火車票難等方面的系列問題，直言學(xué)校領(lǐng)導(dǎo)不作為。沒等會(huì)議結(jié)束，陪同方毅前來的黨委書記楊海波臉色已經(jīng)非常難看。
即便如此，問題該提還是提，學(xué)校對(duì)頂尖學(xué)生的培養(yǎng)絲毫不打折扣。甚至正是由于擔(dān)任學(xué)生會(huì)主席的原因，張奇?zhèn)ズ头絼?lì)之副校長(zhǎng)多次接觸，反而被鼓勵(lì)學(xué)生干部應(yīng)帶頭積極參與第一批CUSPEA（李政道先生組織的中美聯(lián)合培養(yǎng)物理類研究生計(jì)劃）項(xiàng)目。
張奇?zhèn)?、湯超、李明，坐火車去北京參加CUSPEA面試時(shí)留影
張奇?zhèn)ヌ岬剑莻€(gè)年代物理科學(xué)對(duì)年輕人有極大的吸引力，當(dāng)他準(zhǔn)備復(fù)習(xí)CUSPEA考試后，干脆直接放棄學(xué)習(xí)本專業(yè)的課程，每天一門心思聽物理課。課后還和準(zhǔn)備考試的小組成員們聚在一起辯論，并邀請(qǐng)方勵(lì)之校長(zhǎng)參加討論。
在這個(gè)自發(fā)性的討論小組中，每次都有兩個(gè)人慷慨善辯，一個(gè)就是張奇?zhèn)サ耐嗤瑢W(xué)，2019年當(dāng)選為中國(guó)科學(xué)院院士的湯超；另外一個(gè)，則是1981年以全國(guó)第一名成績(jī)通過CUSPEA，現(xiàn)任MIT物理系教授的文小剛。實(shí)際上，中學(xué)時(shí)湯超最喜歡物理，但高考那年中科大和北大的物理系在江西都不招生，只好選擇了中科大力學(xué)系。出于對(duì)物理的熱愛，大學(xué)時(shí)湯超自學(xué)了不少物理，還常去旁聽物理系的課，直到CUSPEA項(xiàng)目才圓了他的“物理夢(mèng)”。而這，也讓湯超與張奇?zhèn)ビ辛顺Ｄ曷?lián)絡(luò)的可能。后來，湯超去往芝加哥大學(xué)攻讀統(tǒng)計(jì)物理學(xué)，師從統(tǒng)計(jì)物理大師Leo Kadanoff，張奇?zhèn)トネ_格斯大學(xué)，同樣攻讀統(tǒng)計(jì)物理，師從當(dāng)時(shí)頗有聲望的Joel L. Lebowitz教授。那時(shí)，兩人一個(gè)23歲，一個(gè)25歲。
1981年，在李政道夫婦的不懈努力下，100多名首屆CUSPEA赴美留學(xué)生，成為最先走出國(guó)門的知識(shí)分子。張奇?zhèn)ブ北济绹?guó)東北部的羅格斯大學(xué)，是同批學(xué)生中離家極遠(yuǎn)的一位。
到美國(guó)，姑媽建議張奇?zhèn)ビ糜⑽拿諱ichael（Mike）便于當(dāng)?shù)厝朔Q呼（因?yàn)槊绹?guó)人不會(huì)發(fā)Qi的音），還成為Joel L. Lebowitz教授的弟子。
就在張奇?zhèn)グ輲煹那耙荒辏?0歲的Lebowitz憑借在非平衡態(tài)統(tǒng)計(jì)力學(xué)領(lǐng)域的工作，當(dāng)選為美國(guó)國(guó)家科學(xué)院院士。在美國(guó)學(xué)術(shù)界，這一榮譽(yù)僅次于諾獎(jiǎng)。此后，Lebowitz包攬了諸多頂級(jí)物理學(xué)榮譽(yù)，包括玻爾茲曼獎(jiǎng)?wù)拢?992年）、美國(guó)物理學(xué)會(huì)尼科爾森獎(jiǎng)?wù)拢?994 年）、亨利龐加萊獎(jiǎng)（2000 年）、沃爾泰拉獎(jiǎng)（2001 年）和馬克斯普朗克獎(jiǎng)（2007 年）。
不久前，92歲的Lebowitz還與另外兩位物理學(xué)家共同獲得“2022年狄拉克獎(jiǎng)”，以表彰他們對(duì)經(jīng)典和量子物理系統(tǒng)的統(tǒng)計(jì)力學(xué)理解所做的開創(chuàng)性、數(shù)學(xué)上嚴(yán)格的貢獻(xiàn)。
值得一提的是，Lebowitz在統(tǒng)計(jì)物理領(lǐng)域有如此大的成就，與他的博士后導(dǎo)師Lars Onsager密不可分。
Joel L. Lebowitz Lars Onsager
Lars Onsager是挪威裔的美國(guó)化學(xué)家，理論物理學(xué)家，甚至可視為“20世紀(jì)的傳奇人物”，1968年因?yàn)閷?duì)不可逆過程熱力學(xué)理論的貢獻(xiàn)獲得了諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)。
此外，Onsager對(duì)統(tǒng)計(jì)物理的一個(gè)突出貢獻(xiàn)，是他出人意料地求出了二維伊辛模型（-2D-Ising）的嚴(yán)格解（通俗可理解為液體氣體臨界狀態(tài)方程的解），為所有復(fù)雜系統(tǒng)相變、對(duì)稱破缺和重整化群理論奠定了基石。
這件事情讓當(dāng)時(shí)的物理學(xué)家們頗為震撼。楊振寧當(dāng)年曾經(jīng)兩次努力試圖看懂Onsager的方法都未能成功，直至第三次才成功并繼續(xù)計(jì)算了二維伊辛模型的磁化率，并和李政道一起研究伊辛模型在復(fù)平面的解析性，暗示與黎曼猜想的聯(lián)系。
或許是研究使然，Onsager的諸多成果在當(dāng)時(shí)很少有人能夠理解，他的工作常常被忽視，他所研究的問題和產(chǎn)生的想法往往得不到同事的響應(yīng)。
曾有人在Onsager故去后唏噓，“Onsager是走在他那個(gè)時(shí)代20年后的人”。
此事讓張奇?zhèn)ジ杏|頗多，他談到，“這并非發(fā)生在Onsager身上的孤例，另一位統(tǒng)計(jì)物理的大師玻爾茲曼又何嘗不是，甚至更悲慘，他選擇了自殺，希望以此結(jié)束自己在動(dòng)理方程和H定理上所遭遇的激烈詰難?！?/p>
但正因如此，Onsager的很多經(jīng)典研究被諸多學(xué)者接棒。
張奇?zhèn)フ劦?，他在Lebowitz那里一待就是六年，期間，因?yàn)長(zhǎng)ebowitz的辦公室在數(shù)學(xué)系，并擔(dān)任應(yīng)用數(shù)學(xué)中心主任，經(jīng)常有著名的數(shù)學(xué)物理學(xué)家到此做訪問學(xué)者，“而大家的共同志趣是將Onsager的相變理論，推廣到非平衡態(tài)系統(tǒng)（即有能量耗散且更復(fù)雜的系統(tǒng)）中去?！?/p>
對(duì)張奇?zhèn)ザ?，非平衡態(tài)統(tǒng)計(jì)物理學(xué)也是他博士期間的主要課題。
“我的主要工作是用大型超級(jí)計(jì)算機(jī)模擬非平衡態(tài)Ising模型，證明相變?nèi)匀淮嬖冢遗R界指數(shù)發(fā)生極化。”他進(jìn)一步講到，“這一研究主要用于模擬等離子流體系統(tǒng)低溫下的相變圖（通俗來講，在電場(chǎng)作用下穩(wěn)流也會(huì)發(fā)生平行的氣-液分離），可應(yīng)用于廣泛的流體熱力學(xué)系統(tǒng)。然而迄今為止，非平衡態(tài)統(tǒng)計(jì)力學(xué)始終還沒有多少嚴(yán)格理論或解析解（嚴(yán)格解）?！?/p>
有關(guān)讀博的日子，張奇?zhèn)テ届o而又松弛。實(shí)際上，這也是他日后教育育人的風(fēng)格。
在學(xué)術(shù)上，他師出名門，很快便意識(shí)到對(duì)科學(xué)問題的選擇比解決科學(xué)問題本身更重要，且大數(shù)據(jù)模擬是做理論不可或缺的，并爭(zhēng)取獲得了由美國(guó)國(guó)家科學(xué)基金會(huì)所頒發(fā)的“普林斯頓超級(jí)計(jì)算機(jī)獎(jiǎng)學(xué)金”（NSF-Princeton Super-computer Fellowship）。
在生活上，他的妻子攻讀Rutgers統(tǒng)計(jì)系碩士學(xué)位，婚后兩人住在學(xué)校分的一套兩居室的房子里，不久后有了第一個(gè)孩子?？臻e時(shí)間，他還游歷美國(guó)，諸如芝加哥一號(hào)堆（世界第一反應(yīng)堆）、西爾斯大廈（當(dāng)時(shí)世界最高的建筑）、普林斯頓-羅格斯大學(xué)聯(lián)合舉辦的數(shù)學(xué)物理年度度假靜修會(huì)，等等。
1987年收獲季節(jié)：兒子剛滿一歲，張奇?zhèn)ィú┡c妻子（碩）、妹妹（碩）同時(shí)畢業(yè)
當(dāng)身邊的一切事情向好時(shí)，抓住一切機(jī)會(huì)留在美國(guó)讀書的想法在張奇?zhèn)バ睦镌赂?/p>
多年后，他曾在一篇回憶錄中寫道，“那時(shí)我的思想發(fā)生了巨大變化，我開始意識(shí)到：本科生的能力評(píng)估是知識(shí)的吸收程度，而研究生則要是知識(shí)的生產(chǎn)?！?/p>
此后，張奇?zhèn)ソo自己定的下一個(gè)指標(biāo)：每年至少能發(fā)表一篇論文。
1987年，張奇?zhèn)ケ粚?dǎo)師的好友，紐約大學(xué)Courant數(shù)學(xué)科學(xué)研究所（CMCL）的Jerry Percus（Percus–Yevick 理論的創(chuàng)立者）“點(diǎn)名”做自己的博士后，繼續(xù)統(tǒng)計(jì)力學(xué)研究。
1990年，張奇?zhèn)ィㄓ乙唬┰俅我姷絃ebowitz（中），Percus（右二）
紐約大學(xué)成立于1831年，是美國(guó)唯一一座坐落于紐約心臟地帶的名校。紐約大學(xué)的特殊之處，莫過于整所大學(xué)并沒有嚴(yán)格意義上的校園，教學(xué)樓與城市融為一體，隨處可見高高掛起的紫色火炬校標(biāo)。
早在張奇?zhèn)淼郊~約大學(xué)之前，他已經(jīng)得知CMCL素有“數(shù)學(xué)神級(jí)殿堂”的美譽(yù)，而他選擇的應(yīng)用數(shù)學(xué)方向，更是連續(xù)多年在U.S .News排名中位列全美第一。
讓張奇?zhèn)ビ∠笊羁痰囊淮危莻髡f中被譽(yù)為“時(shí)代的第二位歐拉”的匈牙利“流浪數(shù)學(xué)家”保羅·埃爾德什（Paul Erd?s），幾乎每年都在紐約大學(xué)克朗所一間毫不起眼的演講大廳里發(fā)表即興演講，“現(xiàn)場(chǎng)人潮擁擠，年輕的聽眾卻熱情洋溢，每次都有一些人聲稱解決某個(gè)‘埃爾德什問題’，因此可以獲得埃爾德什親自頒發(fā)的獎(jiǎng)金。”
Paul Erd?s
事實(shí)上，埃爾德什是一個(gè)博學(xué)的人，對(duì)歷史了如指掌，但長(zhǎng)大后只專注數(shù)學(xué)，對(duì)任何其他事情毫不關(guān)心。國(guó)際數(shù)學(xué)圈甚至將數(shù)學(xué)家劃分為：Erd?s#1（與Erd?s直接合作者，比如Lax），Erd?s#2（與Erd?s#1合作者，比如張奇?zhèn)プ鳛長(zhǎng)ax的合作者）。
張奇?zhèn)グ阎饕ν度霐?shù)學(xué)和物理領(lǐng)域，在Jerry Percus教授的指導(dǎo)下，進(jìn)行非均勻流體模型的密度或熵泛函的博士后研究。
他回憶道，“Percus和Lebowitz，Onsager一樣，著迷在嚴(yán)格可解的統(tǒng)計(jì)力學(xué)理論模型，致力于研究該領(lǐng)域最復(fù)雜、多年懸而未解的那一類。”
那種難度有多大？張奇?zhèn)バ稳荩爸钡轿覀儙熗絺z研究?jī)赡旰螅胖饾u意識(shí)到，嚴(yán)格解和可積性在數(shù)學(xué)上有很深的聯(lián)系?！钡谌?，張奇?zhèn)フ业紺MCL前所長(zhǎng)Peter Lax教授，希望能夠獲得這位偏微分方程領(lǐng)域權(quán)威的指導(dǎo)。
實(shí)際上，這樣的“毛遂自薦”張奇?zhèn)ゲ⒉簧僮?。早在他博士第二年的寒假?983冬），就曾一人奔赴美國(guó)最負(fù)盛名的物理學(xué)研究中心--費(fèi)米實(shí)驗(yàn)室，敲開高能物理Thomas J. Devlin教授辦公室的門，要求在他所領(lǐng)導(dǎo)的國(guó)際對(duì)撞機(jī)高能實(shí)驗(yàn)團(tuán)隊(duì)從事寒假工作。
1983年寒假，芝加哥費(fèi)米實(shí)驗(yàn)室，和Prof. Thomas J. Devlin留影
時(shí)隔八年后，張奇?zhèn)ト匀槐３种白约赫页雎贰钡呐深^，也讓他的研究終于在博士后最后一年出現(xiàn)轉(zhuǎn)機(jī)。
1991年2月，由他獨(dú)立署名的論文發(fā)表在數(shù)學(xué)物理界的最高期刊《Communications in Mathematical Physics》。
能登上這一期刊的論文，大多是數(shù)學(xué)物理方向的奠基性研究成果，甚至被學(xué)界視為摘得菲爾茲獎(jiǎng)（因諾貝爾獎(jiǎng)未設(shè)置數(shù)學(xué)獎(jiǎng)，故該獎(jiǎng)被譽(yù)為“數(shù)學(xué)界的諾貝爾獎(jiǎng)”）的“風(fēng)向標(biāo)”。
因此，如果在張奇?zhèn)パ刂鴶?shù)學(xué)這條道路走下去，大概率是能夠做出領(lǐng)域更高水準(zhǔn)的工作。但事實(shí)上，在1990年10月投稿不久，他便決定1991年伊始入職冷泉港實(shí)驗(yàn)室，徹底從一位“數(shù)學(xué)物理學(xué)者”變成了“生物學(xué)者”。
這種橫跨多學(xué)科的變化在當(dāng)時(shí)并不少見，可以說，自20世紀(jì)40年代以來，物理學(xué)家投入生物學(xué)研究就已蔚然成風(fēng)，包括1962年因發(fā)現(xiàn)“DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)”而獲得諾貝爾獎(jiǎng)的三位科學(xué)家——James Watson、Francis Crick和Maurice Wilkins。
此后，這場(chǎng)跨界之舉直接帶來了20世紀(jì)生物學(xué)研究的爆發(fā)式成長(zhǎng)，并催生了“分子生物學(xué)”的誕生。然而，當(dāng)所有人追根溯源尋找變革之初的那根“導(dǎo)火索”，發(fā)現(xiàn)是一本出自物理學(xué)家薛定諤（Erwin Schr?dinger），僅僅二百余頁的書刊--《生命是什么》。
但對(duì)張奇?zhèn)ザ裕缤瑢?duì)很多前輩（包括James Watson）一樣，這本書也打開了他走向生物學(xué)研究的大門。很快，越來越多關(guān)于未來人類基因組計(jì)劃的討論和報(bào)道，如潮水般向他襲來。
1944年出版的《生命是什么?》
薛定諤本人也是受Max Delbrück（物理出身、諾貝爾獎(jiǎng)得主、分子生物學(xué)之父）工作的啟發(fā)
1988年，張奇?zhèn)ピ凇睹绹?guó)科學(xué)家》上看到Charles DeLisi（時(shí)任美國(guó)能源部健康與環(huán)境研究項(xiàng)目主任）的兩篇文章，一篇是《人類基因組計(jì)劃》，另一篇是《Science》上的《分子生物學(xué)中的計(jì)算機(jī)：當(dāng)前應(yīng)用和新趨勢(shì)》。
其中一句話寫到，“作為生物學(xué)的第一個(gè)‘大科學(xué)’項(xiàng)目，繪制和破譯人類DNA的完整序列，將刺激從計(jì)算機(jī)技術(shù)到理論化學(xué)等領(lǐng)域的研究?！?/p>
張奇?zhèn)ヮA(yù)感一場(chǎng)史無前例的生物醫(yī)學(xué)革命正在逼近。
1989年，冷泉港研究所（CSHL)的創(chuàng)始所長(zhǎng)James Watson，兼任美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院(NIH)人類基因組研究辦公室的第一任主任。
一年后（1990年），他將原任職于Los Alamos國(guó)家實(shí)驗(yàn)室（全球Top10，最早建立Genbank的地方）的數(shù)據(jù)庫(kù)專家Tom Marr請(qǐng)到CSHL，組建起冷泉港第一個(gè)生物信息學(xué)中心和基因組數(shù)據(jù)庫(kù)。
此時(shí)正值美國(guó)，英國(guó)發(fā)起的人類基因組計(jì)劃開始階段，后來逐步涉及世界上幾乎所有國(guó)家，包括發(fā)達(dá)國(guó)家和發(fā)展中國(guó)家，聯(lián)合國(guó)的大多數(shù)機(jī)構(gòu)。同時(shí)，這一項(xiàng)目也吸引了眾多領(lǐng)域科學(xué)家的參與，既有成熟的遺傳學(xué)家，物理學(xué)家、計(jì)算機(jī)科學(xué)家、也有年輕的實(shí)習(xí)生或?qū)W生。
毫無疑問，這是歷史上第一次當(dāng)一個(gè)科學(xué)項(xiàng)目成為全球研究焦點(diǎn)的真實(shí)反應(yīng)。
Tom Marr通過朋友各處招聘頂尖計(jì)算人才分析海量基因組數(shù)據(jù)。1991年，張奇?zhèn)?、William Chang(伯克利計(jì)算機(jī)科學(xué)系Eugene Lawler的博士生，后來到百度做創(chuàng)始CTO)、Wentian Li（Columbia University物理系，現(xiàn)就職Feinstein Institutes for Medical Research）一起，作為助研加入冷泉港的生物信息學(xué)中心，與Rich Roberts、Adrian Krainer、David Beach、Dick McCombie等諸多分子生物學(xué)和基因組學(xué)科學(xué)家一起工作，開始了自己全新而漫長(zhǎng)的生命科學(xué)研究的生涯。
“事實(shí)上，一個(gè)人永遠(yuǎn)不知道畢業(yè)后外面的世界會(huì)發(fā)生什么，正如羅馬人說的：運(yùn)氣是當(dāng)準(zhǔn)備遇到機(jī)會(huì)時(shí)發(fā)生的。”時(shí)隔多年，當(dāng)張奇?zhèn)セ厥鬃约荷砩系淖兓X得那是一種意料之外的必然。
如今來看，人類基因組計(jì)劃已成為生物科學(xué)和人類健康取得重大進(jìn)展的基石。
但在上世紀(jì)八、九十年代，那些尚未被歷史具名的人們，很長(zhǎng)時(shí)間都在和爭(zhēng)議懷疑、希望憧憬所抗?fàn)帯?/p>
被譽(yù)為“生物信息學(xué)之父”的Michael S. Waterman曾回憶那段草莽期，“晚飯后，Walter Gilbert（分子生物學(xué)的早期研究者之一，在Watson實(shí)驗(yàn)室從物理轉(zhuǎn)到分子生物，因發(fā)明化學(xué)DNA測(cè)序方法拿到諾獎(jiǎng)）回到工位，一邊喝著白蘭地，一邊琢磨著怎么才能有精力去做那些無聊而重復(fù)的測(cè)序工作。他不止一次提出強(qiáng)烈而離譜的建議：我們應(yīng)該用犯人來做這項(xiàng)工作。
Walter Gilbert
對(duì)所有人來說，這一曠世項(xiàng)目都是一次精神和智識(shí)上的轉(zhuǎn)變。
那時(shí)張奇?zhèn)?5歲，對(duì)嶄新的生命科學(xué)有無法抑制的激動(dòng)，筆記的一頁中寫道，“還有什么比破解生命密碼和理解我們自己的DNA更有趣?”
但作為一名長(zhǎng)期使用數(shù)學(xué)語言的學(xué)者，如何才能找到有價(jià)值的生物學(xué)問題，是張奇?zhèn)ッ媾R的首道難題。
根據(jù)分子生物學(xué)“中心法則”，生物信息由基因到表型經(jīng)過“DNA-RNA-蛋白質(zhì)”不同的調(diào)控層次。
當(dāng)時(shí)基因組DNA測(cè)序步驟，先將DNA隨機(jī)打斷，再把這些片段（~150kb）克隆到酵母載體中去，通過雙端測(cè)序得到“anchor”DNA序列，利用anchor序列聚類將隨機(jī)DNA片段連續(xù)排列得到“Physical Mapping”，最后對(duì)最短路徑中每一個(gè)DNA克隆片段打斷進(jìn)行“shotgun sequencing”（霰彈槍測(cè)序）和序列組裝。
因此，如何快速定量估計(jì)Mapping和sequencing的覆蓋率，是每個(gè)基因組中心面臨的一件大事。
張奇?zhèn)セㄙM(fèi)大量時(shí)間，閱讀了經(jīng)典的Lander-Waterman泊松模型（它可以應(yīng)用于簡(jiǎn)單的克隆片段單端測(cè)序“Fingerprinting”覆蓋率估計(jì)）后，他馬上意識(shí)到，雙端測(cè)序“anchoring”方法可以大大加快meeting速度和覆蓋率，而且正好可以用上跟導(dǎo)師Percus學(xué)到的“Hard-rod Fluid”方法，得到“anchoring mapping”的數(shù)學(xué)嚴(yán)格解。
果然，計(jì)算結(jié)果很快得到了證實(shí)，而且在簡(jiǎn)化為單端“Fingerprinting”和連續(xù)性近似特出情況下，推出Lander-Waterman公式。
這一方法也在冷泉港基因組的“Physical Mapping”實(shí)驗(yàn)中得到了證實(shí)，促使他順利將成果發(fā)布于世界四大頂級(jí)期刊之一的——PNAS。
張奇?zhèn)ゲ⒉粷M足只做理論計(jì)算。他意識(shí)到，要在新領(lǐng)域打天下，不能靠以前的導(dǎo)師和知識(shí)，必須深入了解生物實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的產(chǎn)生過程，還要掌握新領(lǐng)域所用的名詞術(shù)語。
張奇?zhèn){借第一個(gè)重要工作——PNAS文章，拿到了NIH新成立的基因組所設(shè)立的5年“K01基金”，專門獎(jiǎng)勵(lì)從非生物專業(yè)轉(zhuǎn)行從事基因組研究的年輕PI（學(xué)術(shù)帶頭人），使得張奇?zhèn)ゾ哂型耆慕?jīng)濟(jì)獨(dú)立性。
張奇?zhèn)シQ，90年代初，他能參與德州貝勒醫(yī)學(xué)院基因組中心創(chuàng)始人Richard Gibbs舉辦的“高通量基因組測(cè)序與分析學(xué)習(xí)班”，CSHL舉辦的“分子遺傳學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)和裂變酵母細(xì)胞周期課程”，都是得益于此。
通過親自動(dòng)手做一個(gè)個(gè)經(jīng)典實(shí)驗(yàn)，張奇?zhèn)ンw會(huì)到一個(gè)跨學(xué)科研究者，尤其是面向生物學(xué)上的原始數(shù)據(jù)時(shí)，“首要任務(wù)不是深入分析，而是了解數(shù)據(jù)是如何產(chǎn)生的、誤差的主要來源、數(shù)據(jù)的質(zhì)量和數(shù)量是否充足。”
1993年，張奇?zhèn)ィㄗ笠唬﹨⒓覥SHL酵母分子遺傳實(shí)驗(yàn)集訓(xùn)課程
作為這些課程中唯一一個(gè)華人面孔，張奇?zhèn)サ倪@份勤奮相繼獲得了同事的欣賞和信任。而這其中的一個(gè)重要人物，就是被稱為“斷裂基因與RNA剪切發(fā)現(xiàn)鼻祖”的英國(guó)人Rich Roberts。Roberts是最早提倡生物信息研究的人之一，由他主編的NAR雜志每年都有生物信息數(shù)據(jù)庫(kù)和算法的特刊，1993年，在他剛剛離開CSHL就拿到了“發(fā)現(xiàn)RNA剪接”的諾獎(jiǎng)，還因此被英國(guó)女王親封為英國(guó)皇家爵士，入選英國(guó)皇家科學(xué)院院士。
Rich Roberts
說起與Rich Roberts的緣分，張奇?zhèn)シQ，從自己一進(jìn)CSHL，就經(jīng)常跑到隔壁Rich Roberts辦公室請(qǐng)教各種問題。因此，一些經(jīng)典研究常常在兩人一問一答間誕生：
當(dāng)張奇?zhèn)柕?，“拿到基因組序列最重要的問題是什么”，Rich答，“找基因最難點(diǎn)”，馬上Rich又補(bǔ)上一句，“正確識(shí)別外顯子-內(nèi)含子（exon-intron）”。
就這樣，張奇?zhèn)プ哌M(jìn)了這一課題。1996年，這一研究成果投到PNAS個(gè)人署名的工作MZEF（Michael Zhang Exon Finder）。
后來大量應(yīng)用證明，MZEF在分析難度大（低GC）的第21號(hào)染色體、特別是著名的老年癡呆相關(guān)的超長(zhǎng)基因APP（~300kb, ~20exons）發(fā)揮了重大作用。此外，這種Exon-centric方法正好與全基因gene-centric方法，如在MZEF發(fā)布的三個(gè)月后，Samuel Karlin（國(guó)際頂尖應(yīng)用概率學(xué)家）的學(xué)生Burge發(fā)表的著名的HMM方法Genscan，可以與之完美互補(bǔ)。
實(shí)際上，張奇?zhèn)ゲ⒉皇瞧渲凶罹呱飳W(xué)背景的人，DNA的功能原件預(yù)測(cè)（即外顯子-內(nèi)含子研究）也只是HGP計(jì)劃中的最早期工作，但他在數(shù)次合作中全身心投入，屢次顯示出自己的數(shù)學(xué)物理才能。到1996年，張奇?zhèn){借MEZF工作獲得了第一個(gè)R01獎(jiǎng)，升任助理教授，成立獨(dú)立的計(jì)算生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室，此后便開始大量參與人類基因結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)工作。
張奇?zhèn)ブ匦率崂磉^去研究，首次將人類全部外顯子系統(tǒng)劃分為16類，意外發(fā)現(xiàn)新一類“dual splice-site”（雙重剪接位點(diǎn)）可以形成“零長(zhǎng)度外顯子”，名聲漸大并迅速被諸多教授點(diǎn)名合作。
他與Adrian Krainer、Xiangdong Fu、Robert Darnell、Josh Huang等實(shí)驗(yàn)室，在RNA剪接調(diào)控和RNA蛋白結(jié)合方面建立起密切而長(zhǎng)期的合作關(guān)系，便從那時(shí)開始。
2001年，張奇?zhèn)ズ虯ravinda Chakravarti（現(xiàn)任紐約大學(xué)人類遺傳學(xué)與基因組學(xué)中心主任，和張奇?zhèn)ヒ黄鹋e辦冷泉港第一屆計(jì)算生物學(xué)國(guó)際會(huì)議）；張奇?zhèn)ズ?B. Stillman（冷泉港研究所所長(zhǎng)）
諸多合作者不吝贊賞，“張奇?zhèn)?duì)神經(jīng)細(xì)胞重要因子REST/NRSF 、Pumilio、Rbfox調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的研究以堪稱經(jīng)典。
他開發(fā)的ESEfinder、SpliceTrap、Olego、HITS-CLIP分析方法等RNA剪接計(jì)算分析工具，一直為全世界生信領(lǐng)域多數(shù)實(shí)驗(yàn)室或生物制藥公司所廣泛應(yīng)用。”
直到最近，張奇?zhèn)プC明，單細(xì)胞RNA-seq可以通過精細(xì)計(jì)算分出不同poly-A尾巴（last-exon）的mRNA isoform，并以此劃分不同功能的神經(jīng)元細(xì)胞?？梢哉f，RNA分析是所有分子生物實(shí)驗(yàn)室的“bread&butter”（謀生之道），跟隨不斷更新的實(shí)驗(yàn)技術(shù)開發(fā)新的計(jì)算方法，也是張奇?zhèn)?shí)驗(yàn)室近30年沒有停止的工作。
進(jìn)入新世紀(jì)以來，美國(guó)社會(huì)環(huán)境不斷變化，從2001年“9.11”恐怖襲擊到2008年金融海嘯，張奇?zhèn)ヒ彩艿讲簧儆绊憽?/p>
他稱，一邊是妻子早出晚歸在世貿(mào)中心工作，長(zhǎng)輩在紐約老人院床位緊張，一邊是他自己，需要抽出越來越多的時(shí)間去申請(qǐng)不斷緊縮的政府基金(CSHL100%靠基金)。
2009年，正好有機(jī)會(huì)，德州政府要加大癌癥研究投資，同時(shí)德克薩斯大學(xué)達(dá)拉斯分校（UT Dallas）邀請(qǐng)張奇?zhèn)トプ龅谝蝗蜗到y(tǒng)生物學(xué)資深講席教授，并創(chuàng)建系統(tǒng)生物學(xué)中心。此事籌劃一年，等兩個(gè)孩子都上了大學(xué)，2010年張奇?zhèn)グ讶疫w到達(dá)拉斯，開啟了教書育人的新篇章。
雖然重建實(shí)驗(yàn)室和教書對(duì)科研有所影響，但張奇?zhèn)ジ吓笥讶伪〞r(shí)任UCSD表觀遺傳聯(lián)合研究中心主任）的合作從未停止。他們?cè)趪?guó)際上率先發(fā)表了染色體結(jié)構(gòu)關(guān)鍵因子CTCF在人體細(xì)胞基因組上所有的結(jié)合位點(diǎn)、TFBS motif，等張奇?zhèn)グ岬経TD后，兩人將Roadmap Epigenome Project（表觀基因組路線圖項(xiàng)目）的合作項(xiàng)目圓滿完成。
后來，任兵繼續(xù)參加美國(guó)的4D核糖體（4D Nucleome）計(jì)劃，而作為客座教授的張奇?zhèn)マD(zhuǎn)而指導(dǎo)清華基因組研究團(tuán)隊(duì)，開發(fā)了一系列染色體3D結(jié)構(gòu)實(shí)驗(yàn)技術(shù)的算法，并和阮一駿（Jackson Lab，現(xiàn)在浙江大學(xué)）合力推動(dòng)中國(guó)3D基因組研究和人才培養(yǎng)。
這些年來，在開展生物學(xué)研究方面，張奇?zhèn)サ难芯款I(lǐng)域隨著HGP計(jì)劃深入和拓展而逐漸發(fā)展，包括從基因到啟動(dòng)子到增強(qiáng)子等順式調(diào)控元件，從轉(zhuǎn)錄到RNA剪接等轉(zhuǎn)錄后調(diào)控，從表觀遺傳學(xué)到4D基因組，從單細(xì)胞組學(xué)到組織器官時(shí)空多組學(xué)。最近，為了能夠更好的實(shí)現(xiàn)從分子--細(xì)胞--組織--器官--個(gè)體系統(tǒng)生物學(xué)的跨越，張奇?zhèn)ビ珠_始了“早期胚胎發(fā)育中細(xì)胞-細(xì)胞相互作用網(wǎng)絡(luò)”的研究。
科學(xué)無止境，他那活到老學(xué)到老的精神給年輕一代樹立了典范。而對(duì)于張奇?zhèn)ケ救硕?，他則認(rèn)為，“生物學(xué)問題一環(huán)扣一環(huán)、缺一不可。在生物信息領(lǐng)域，新方法層出不窮，如同要瞄準(zhǔn)不斷變化運(yùn)動(dòng)中的目標(biāo)，難度要比解百年不變的數(shù)學(xué)難題大得多。”
也正因如此，使得他更加期盼 Walter Gilbert（哈佛大學(xué)教授，前面提到的）教授在1991年的預(yù)言早日到來：新的研究范式正在興起，當(dāng)所有基因都被找到（被保存在數(shù)據(jù)庫(kù)中），理論研究將是生物學(xué)研究的起點(diǎn)。
2001年，第一張人類基因組草圖發(fā)表，預(yù)言成真。但如果站在科學(xué)的角度上審視，這一成功并非盡善盡美。哈佛大學(xué)John Quackenbush曾在2021年指出，“二十年前兩個(gè)人類基因組幾乎同時(shí)發(fā)表，這里面既有科學(xué)和技術(shù)的勝利，也有政治妥協(xié)的成分?！輬D’的概念非常模糊，導(dǎo)致了很多怪事——2001年宣布草圖完成，2006年宣布最長(zhǎng)的1號(hào)染色體測(cè)序完成，而其它染色體完成時(shí)間還要更晚，比如X染色體在2020年才宣布完成，Y染色體至今沒有消息。
2021年，一份完整的人類基因組才終于發(fā)表在bioRxiv上（文章于2022年發(fā)表于Science）。
目前關(guān)于基因組還有很多問題有待回答，比如人類基因的數(shù)量、基因的定義等等，我們目前得到的任何版本的基因組都仍然是不完美、不精確的?！?/p>
在基因組計(jì)劃后的二十余年里，大數(shù)據(jù)的產(chǎn)生和計(jì)算效率的提升，促使無數(shù)學(xué)者為完善人類基因組，解碼它的遺傳發(fā)育功能以及治病的機(jī)理而持續(xù)努力。
張奇?zhèn)ブv到， “因?yàn)闊o論如何，HGP已經(jīng)引領(lǐng)了一條不歸路，在我們看到真正的光明之前，還有很長(zhǎng)的路要走。”
張奇?zhèn)W(xué)術(shù)生涯的另一面，扎在了中國(guó)。
1999年，湯超受李政道委托，開始籌建北大定量生物學(xué)中心的前身——北大理論生物學(xué)中心。最初湯超每年寒暑假回來兩三個(gè)月，后來有了北大來魯華、佘振蘇、歐陽頎等教授的幫助，2001年中心正式成立，張奇?zhèn)ケ惚谎?qǐng)擔(dān)任學(xué)術(shù)委員會(huì)顧問。
2002年，李政道理論物理中心樓前：李振勤（中科大1981第一批CUSPEA第一名），來魯華、張奇?zhèn)?、佘振蘇
那時(shí)張奇?zhèn)ヒ呀?jīng)離故土二十年了，參與培育和扶持一批年輕的國(guó)內(nèi)生物信息學(xué)研究人員，成為他的一大心愿。
他意識(shí)到，加大與中國(guó)學(xué)者交流，將是最好的“突破口”。
2000年，張奇?zhèn)?yīng)邀在南韓Pohang生物技術(shù)大會(huì)發(fā)言，結(jié)識(shí)了代表上海中國(guó)南方基因組中心發(fā)言的陳竺，并相約兩年后在上海見面。那一年，陳竺被任命為中科院副院長(zhǎng)，從上海轉(zhuǎn)戰(zhàn)到北京，主管生物技術(shù)局和國(guó)際合作局。對(duì)于這次結(jié)識(shí)，陳竺高興，張奇?zhèn)バ老?，一個(gè)想推動(dòng)中國(guó)生信與國(guó)際接軌，一個(gè)想為國(guó)家學(xué)科發(fā)展做些事情。
2002年4月，按約定張奇?zhèn)トド虾⒓佑申愺弥鞒值摹?002年全球人類基因組大會(huì)(HGM2002)”，會(huì)后陳竺還委派趙國(guó)屏（時(shí)任中科院上海生命科學(xué)研究院副院長(zhǎng)）帶其參觀了南方基因組中心、蔣華良的藥物所、上海交大賀林遺傳病實(shí)驗(yàn)室，以及李亦學(xué)組建的上海生物信息技術(shù)研究中心（下稱“中心”）。
值得一提的是，自2000年李亦學(xué)回國(guó)之后，一手創(chuàng)建了中科院上海生命科學(xué)研究院生物信息學(xué)中心。后來，他繼續(xù)整合上海生物信息學(xué)主要研究力量，有，中國(guó)科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院、國(guó)家人類基因組南方研究中心、復(fù)旦大學(xué)、上海交通大學(xué)、上海醫(yī)藥工業(yè)研究院等11家科研單位，最終才在2002年組建為中心。
張奇?zhèn)バ纳磁?，“短短幾年，中心已成為?guó)家生物信息技術(shù)研究的支撐基地?！倍@也再次印證2003年徐鷹教授回國(guó)創(chuàng)辦IBW（國(guó)際生物信息學(xué)研討會(huì)），首屆會(huì)議定在上海實(shí)屬良策。
實(shí)際上，那時(shí)陳竺心里還有一個(gè)大膽的想法，希望將德國(guó)馬普學(xué)會(huì)（Max-Planck-Gesellschaft，MPG）引入上海。
作為長(zhǎng)期盤踞在世界科研機(jī)構(gòu)前三甲的科研巨佬，馬普學(xué)會(huì)在體量和結(jié)構(gòu)上可以對(duì)標(biāo)中國(guó)的中科院。而陳竺的打算正是強(qiáng)強(qiáng)聯(lián)合，成立“中國(guó)科學(xué)院-馬普學(xué)會(huì)計(jì)算生物學(xué)伙伴研究所”(下稱“馬普所”)。
選第一屆馬普所所長(zhǎng)時(shí)留影：Dr. Andreas Dress (前排右二)，陳竺（前排右四）
2004年，陳竺和裴鋼（時(shí)任上海生科院院長(zhǎng)，后擔(dān)任同濟(jì)校長(zhǎng)）試圖招募張奇?zhèn)?dān)任研究所主任之一，盡管盛情難卻，但張奇?zhèn)タ紤]到金力（Cavalli-Sforza博士后）已經(jīng)是復(fù)旦生命科學(xué)學(xué)院院長(zhǎng)，便將金力推向臺(tái)前。
這也讓金力后來總跟張奇?zhèn)ラ_玩笑，“不應(yīng)讓我頂替你的位置?！?/p>
但張奇?zhèn)ズ秃掳亓忠黄鹦廊唤邮芰丝茖W(xué)顧問委員會(huì)成員，后來正是他大力舉薦韓敬東（博士后師從哈佛Dana Farber）擔(dān)任馬普所第二任輪值所長(zhǎng)（現(xiàn)任北大教授）。
為何張奇?zhèn)]有選擇留在上海？
陳潤(rùn)生院士對(duì)《雷峰網(wǎng)》講到，“當(dāng)時(shí)張奇?zhèn)ハ胍貒?guó)做兼職教授，北大生命學(xué)院院長(zhǎng)周曾銓已到冷泉港和他談好，而他家人的清華出身則希望他同校客座?！?/p>
后來的事情便是孫之榮、程京、饒子和得到了陳潤(rùn)生的消息，三位教授迅速出面，說服張奇?zhèn)シ艞壉贝蟆Ｔ俸髞?，?dān)心張奇?zhèn)フ猩粔?，陳?rùn)生還將他在華大基因培養(yǎng)的最好博士生送去冷泉港。
陳潤(rùn)生、孫之榮、程京、饒子和
2008年5月，在張奇?zhèn)?，張學(xué)工（清華自動(dòng)化系教授），李衍達(dá)院士（清華自動(dòng)化系前系主任）三位學(xué)者的籌措下，我國(guó)第一個(gè)生物信息學(xué)與系統(tǒng)生物學(xué)講席教授組發(fā)展開來。
在此期間，張奇?zhèn)ミ^去廣濟(jì)人脈的長(zhǎng)處派上用場(chǎng)，生物信息學(xué)的奠基人之一的Michael S. Waterman受聘為講席教授組首席科學(xué)家，姜濤、王永雄、劉軍、孫豐珠（博士師從Waterman）等多位海外杰出學(xué)者紛至沓來。
2010年，張奇?zhèn)ト肼毭绹?guó)南部的德克薩斯大學(xué)達(dá)拉斯分校。他說到，“正好有個(gè)契機(jī)，他們找到我頭上，到州立學(xué)校無需一天到晚寫基金申請(qǐng)標(biāo)書，浪費(fèi)時(shí)間，又能有機(jī)會(huì)為清華做些事情。”
回首看，21世紀(jì)以來我國(guó)的生物信息學(xué)研究快速發(fā)展、人才大量涌現(xiàn)，離不開老一輩學(xué)者堅(jiān)守陣地，也離不開一批批留洋海外的年輕一輩反哺。對(duì)于張奇?zhèn)ザ?，他總是感慨選擇不易，堅(jiān)定走出一條自己風(fēng)格的道路更是難得。
實(shí)際上，在他通過CUSPEA考試準(zhǔn)備出國(guó)留學(xué)前，還有一段小插曲。
1979年，張奇?zhèn)⒓又腥A全國(guó)學(xué)聯(lián)第十八次代表大會(huì)，和北大學(xué)生會(huì)主席袁純清（一年后李克強(qiáng)接任）、清華學(xué)生會(huì)主席孫建京（一年后林炎志接任）、伍紹祖等人共同當(dāng)選第十八屆全國(guó)學(xué)聯(lián)副主席，受到華國(guó)鋒、鄧小平等領(lǐng)導(dǎo)接見。江湖傳說，清北中科大這樣的學(xué)生會(huì)主席是正廳級(jí)待遇，因?yàn)榇文昕傆袡C(jī)會(huì)出任副部級(jí)單位全國(guó)青聯(lián)、學(xué)聯(lián)的職務(wù)。
在風(fēng)起云涌的1980年代，這批學(xué)子思想積極活躍，對(duì)中國(guó)的前途命運(yùn)有更多憂慮，確實(shí)有很多人藉此通往政壇，走向仕途，諸如袁純清、林炎志、朱善璐、劉能元、陸昊、趙辰昕、陳光浩、周長(zhǎng)奎等多位優(yōu)秀才??；或是商海浮沉，誕生了“明天系”資本帝國(guó)掌門人肖建華、北大光華董事長(zhǎng)李明春和周燕軍等人物。
當(dāng)時(shí)，一個(gè)前所未有的機(jī)會(huì)落在了張奇?zhèn)ド砩稀?/p>
張奇?zhèn)シQ，“在獲得CUSPEA錄取通知書不久，我準(zhǔn)備去上海外語學(xué)院參加集訓(xùn)英語，團(tuán)委書記遠(yuǎn)澤清找到我，帶來了一個(gè)重要消息：時(shí)任全國(guó)青年聯(lián)合會(huì)主席的胡啟立，計(jì)劃在團(tuán)中央籌辦一個(gè)大學(xué)部，以便與愈來愈多的國(guó)際間大學(xué)往來聯(lián)絡(luò)，希望我能跟家人商量，放棄出國(guó)，調(diào)到團(tuán)中央出任第一任大學(xué)部部長(zhǎng)。”
這一機(jī)會(huì)難得，張奇?zhèn)コ伺c家人商量，還親自跑到三位中科大副校長(zhǎng)家中請(qǐng)教。楊承宗（化學(xué)家，也是遠(yuǎn)澤清的老丈人）、錢臨照、方勵(lì)之的一番鼓勵(lì)，最終促使張奇?zhèn)P棄“學(xué)而優(yōu)則仕”，抓住改革開放的良機(jī)，走出國(guó)門，堅(jiān)定走科研之路。
多年后，李政道與CUSPEA學(xué)生的一次聚會(huì)，張奇?zhèn)ィㄓ乙唬?/span>
時(shí)光荏苒，往事已成故事。張奇?zhèn)フ劦?，人的一生是有很多機(jī)遇和選擇的，能夠不受名利地位誘惑，如同“浮士德抵制魔鬼的誘惑”，卻是很不容易的。
1981年，在飛往紐約的飛機(jī)上，張奇?zhèn)ゼ鞍倜袊?guó)學(xué)子，即將在世界歷史上寫下重要一筆。
作者注：
1993年，中國(guó)參與人類基因組計(jì)劃，生物信息學(xué)科迎來大爆發(fā)。在近三十年的時(shí)間里，一大批生物、化學(xué)、物理、計(jì)算等專業(yè)的學(xué)者，前仆后繼加入到學(xué)科的產(chǎn)研建設(shè)，那是一個(gè)靈感迸發(fā)、情誼綿長(zhǎng)的年代，也是一個(gè)走出質(zhì)疑、迷茫的年代。
目前，雷峰網(wǎng)(公眾號(hào)：雷峰網(wǎng))啟動(dòng)《生物信息學(xué)的三十年往事》專題，已陸續(xù)推出徐鷹、潘毅、周耀旗、許東、姜濤、張奇?zhèn)サ葘W(xué)者的人物故事，記錄光輝歲月，以照后人之路。
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