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本文作者: 任平 | 2023-02-14 16:00 |
ChatGPT的熱度,不亞于2016年橫空出世的AlphaGo和2020年的AlphaFold2:前者曾帶動了計算機視覺在醫(yī)療的落地,后者則逼近了在生命科學(xué)特定領(lǐng)域的技術(shù)極限。如今,以ChatGPT為代表的生成式AI技術(shù),能否成為生命科學(xué)進一步突破的技術(shù)引擎?
最近,ChatGPT在各行各業(yè)引起了不小的轟動。
微軟“加倉”,美版頭條BuzzFeed“押注”,就連國內(nèi)科技巨頭,百度、阿里、騰訊、網(wǎng)易、京東、360、字節(jié)……這些耳熟能詳?shù)闹袊ヂ?lián)網(wǎng)公司,也相繼傳出入局的消息。
沉寂已久的AI圈,似乎又回到了7年前AlphaGo時代的熱情。
ChatGPT,不僅僅被看作是簡單的新一代聊天機器人,它甚至代表著人工智能革命性的轉(zhuǎn)折點。
此前曾給ChatGPT站臺的比爾·蓋茨也表示,ChatGPT等人工智能可以為閱讀和寫作提供優(yōu)化,并在醫(yī)療保健和教育等領(lǐng)域切實提高工作效率,“閱讀和寫作現(xiàn)在已經(jīng)在人工智能的能力范圍內(nèi),這將產(chǎn)生非常廣泛的影響。”
ChatGPT這把火,也迅速蔓延至AI生命科學(xué)圈。
最近,加州伯克利的一家初創(chuàng)公司Profluent傳出消息,稱采用類似ChatGPT的蛋白質(zhì)工程深度學(xué)習(xí)語言模型——Progen,首次實現(xiàn)了AI預(yù)測蛋白質(zhì)的合成。
對此,業(yè)內(nèi)眾說紛紜,樂觀派稱,“這項新技術(shù)可能會‘超越諾獎’--比2018年的定向進化蛋白設(shè)計技術(shù)更加強大?!?/strong>
實際上,早在2022年底,國外就有三家公司競相發(fā)布了AIGC×蛋白質(zhì)設(shè)計的新模型。
華盛頓大學(xué)David Baker團隊發(fā)布了RFdiffusion,用擴散模型設(shè)計多種多樣與天然蛋白質(zhì)截然不同的全新單鏈蛋白質(zhì)及復(fù)合體;
Generate Biomedicines公司發(fā)布擴散蛋白生成模型Chroma,可根據(jù)預(yù)設(shè)要求設(shè)計蛋白質(zhì)序列和結(jié)構(gòu);
Meta公司的ESM2,則用基于150億參數(shù)的蛋白質(zhì)序列預(yù)訓(xùn)練大模型實現(xiàn)可編程的蛋白質(zhì)從頭設(shè)計。
前不久,國內(nèi)AI公司天壤也宣布進展,對外公開了升級版的蛋白質(zhì)設(shè)計模型——TRDiffusion。結(jié)果顯示,該款模型不僅適用于已支持的“一鍵生成滿足描述的蛋白質(zhì)”,而且在相同計算資源配置和時間內(nèi),蛋白質(zhì)設(shè)計數(shù)量提升至2倍以上。
天壤創(chuàng)始人薛貴榮對雷峰網(wǎng)(公眾號:雷峰網(wǎng))&《醫(yī)健AI掘金志》表示,“盡管這些公司的技術(shù)路徑不盡相同,但這些模型和算法的集中爆發(fā),意味著我們已經(jīng)邁入了一個可編程的生物學(xué)新時代。換句話說,與蛋白質(zhì)設(shè)計相關(guān)的藥物開發(fā)、疫苗開發(fā)、生物合成和清潔能源等產(chǎn)業(yè),即將迎來產(chǎn)業(yè)大爆發(fā)的關(guān)鍵點。”
一位業(yè)內(nèi)人士更是直言,“今天ChatGPT的熱度,不亞于2016年橫空出世的AlphaGo和2020年的AlphaFold2:前者曾帶動了計算機視覺在醫(yī)療的落地,后者則催生了生命科學(xué)的討論熱度。如今,以ChatGPT為代表的生成式AI技術(shù),或?qū)⒊蔀樯茖W(xué)技術(shù)落地的一道‘催化劑’?!?/p>
不過,從前幾年的實踐經(jīng)驗來看,以計算機視覺為特征的AI,在醫(yī)療領(lǐng)域并未出現(xiàn)“革命性”的顛覆效應(yīng)。
以ChatGPT為代表的AIGC,能否比肩AlphaGo或是AlphaFold2的出現(xiàn)?
AI生命科學(xué)的哪些成果,可以稱之為AIGC?哪些可能只是蹭熱點?
當AIGC大展拳腳,生命科學(xué)領(lǐng)域最明顯的變化會是什么?對于生命科學(xué)而言,AIGC是否有不確定性或者危機?
這些問題的出現(xiàn),對于生命科學(xué)領(lǐng)域以及計算機的從業(yè)者而言,都有著不同尋常的探討空間。
為此,雷峰網(wǎng)將于2月15日(本周三20:00),舉辦《ChatGPT的一把火,能否燒到AI生命科學(xué)界?》的線上圓桌論壇。
本次論壇,將由中國人民大學(xué)數(shù)學(xué)學(xué)院龔新奇擔任主持,中國科學(xué)院深圳理工大學(xué)(籌)計算機科學(xué)與控制工程學(xué)院院長潘毅、百圖生科首席AI科學(xué)家宋樂、深圳灣實驗室系統(tǒng)與物理生物學(xué)研究所資深研究員周耀旗、分子之心創(chuàng)始人許錦波,天壤創(chuàng)始人薛貴榮參與討論。
讀者可掃描文章底部海報的二維碼,進入專家社群,我們會將您的問題收集、匯總,反饋給參會嘉賓,并在討論環(huán)節(jié)進行解答。
主持人:龔新奇,中國人民大學(xué)數(shù)學(xué)學(xué)院教授
中國人民大學(xué)數(shù)學(xué)科學(xué)研究院教授,數(shù)學(xué)智能應(yīng)用實驗室負責(zé)人,中國生物信息學(xué)會(籌)理事,運籌學(xué)會計算系統(tǒng)生物學(xué)分會理事,中國計算機學(xué)會高級會員。清華大學(xué)北京結(jié)構(gòu)生物學(xué)高精尖中心合作研究員,北京智源人工智能研究院特聘研究員,哈佛大學(xué)訪問學(xué)者。
龔新奇教授主要研究興趣是蛋白質(zhì)相互作用復(fù)合物計算,目前已經(jīng)發(fā)表SCI學(xué)術(shù)論文70多篇,包括理論模型、計算方法和生物應(yīng)用三部分,發(fā)表的雜志包括Nature、Science、Nature Communications、Proteins和Science in China等學(xué)術(shù)刊物,論文被引用次數(shù)已超過2900多次,H指數(shù)26。
潘毅,中國科學(xué)院深圳理工大學(xué)(籌),計算機科學(xué)與控制工程學(xué)院,院長
中國科學(xué)院深圳理工大學(xué)計算機科學(xué)與控制工程學(xué)院院長,講席教授、美國醫(yī)學(xué)與生物工程院院士、烏克蘭國家工程院外籍院士、歐洲科學(xué)與藝術(shù)院院士、中民協(xié)元宇宙工委會長。
潘毅院士在清華大學(xué)計算機科學(xué)與工程系獲得本碩學(xué)位,1987年留美,1991年獲匹茲堡大學(xué)計算機科學(xué)博士學(xué)位。此后主要任職為美國佐治亞州立大學(xué),過去十幾年間,潘毅教授該校陸續(xù)擔任計算機系和生物系系主任、文理學(xué)院副院長等職位。
潘毅院士主要研究領(lǐng)域是以云計算、大數(shù)據(jù)分析、人工智能、深度學(xué)習(xí)等為工具,進行生物信息和醫(yī)療信息的研究。在此領(lǐng)域已發(fā)表250多篇SCI期刊學(xué)術(shù)論文,其中100多篇發(fā)表在頂尖的IEEE/ACM Transactions/Journals學(xué)術(shù)期刊上;另在國際學(xué)術(shù)會議錄上發(fā)表150多篇學(xué)術(shù)論文,出版編著了40多本書。他的學(xué)術(shù)成果已被引用超過了20000,目前H指數(shù)90。
宋樂,百圖生科首席AI科學(xué)家
世界知名的機器學(xué)習(xí)專家,現(xiàn)為百圖生科首席技術(shù)官及首席 AI 科學(xué)家,負責(zé)干濕閉環(huán)高通量生物計算引擎的研發(fā)和相關(guān)戰(zhàn)略工作。
宋樂博士是著名的機器學(xué)習(xí)和圖深度學(xué)習(xí)專家,曾任美國佐治亞理工學(xué)院計算機學(xué)院終身教授、機器學(xué)習(xí)中心副主任,阿聯(lián)酋 MBZUAI 機器學(xué)習(xí)系主任,螞蟻金服深度學(xué)習(xí)團隊負責(zé)人(P10)、阿里巴巴達摩院研究員,國際機器學(xué)習(xí)大會董事會成員,具有豐富的 AI 算法和工程經(jīng)驗。
2008年起,宋樂博士在卡內(nèi)基梅隆大學(xué)從事生物計算相關(guān)的研究,利用機器學(xué)習(xí)技術(shù)對靶點挖掘、藥物設(shè)計取得了一系列突破性成果,獲得 NeurIPS、ICML、AISTATS 等主要機器學(xué)習(xí)會議的最佳論文獎。社區(qū)服務(wù)方面,他曾擔任 NeurIPS、ICML、ICLR、AAAI、IJCAI 等 AI 頂會的領(lǐng)域主席,出任 ICML 2022 的大會主席,他還是同行評議期刊 JMLR、IEEE TPAMI 的副主編。
周耀旗,深圳灣實驗室系統(tǒng)與物理生物學(xué)研究所資深研究員
深圳灣實驗室系統(tǒng)與物理生物學(xué)研究所資深研究員。目前,周耀旗課題組通過計算和實驗的結(jié)合,從事蛋白質(zhì)/RNA的序列、結(jié)構(gòu)與功能關(guān)系方面的基礎(chǔ)研究和生物分子檢測、藥物開發(fā)方面的應(yīng)用研究。
周耀旗教授從2021年3月起全職加入了深圳灣實驗室,他是1984年中國科技大學(xué)近代化學(xué)系的學(xué)士,1990年美國紐約州立石溪大學(xué)化學(xué)物理的博士,1994-2000年北卡州立大學(xué)、哈佛大學(xué)的博士后,2000年任紐約州立布法羅大學(xué)助理教授,2004年升為終身副教授,2006年成為印第安納大學(xué)信息學(xué)院和醫(yī)學(xué)院終身正教授,2013-2021年任澳大利亞格里菲斯大學(xué)糖組學(xué)研究所正教授。
周耀旗教授長期在結(jié)構(gòu)生物信息學(xué)方面工作,曾經(jīng)多次在國際蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測和功能預(yù)測比賽中名列前茅。到目前為止共發(fā)表論文250余篇,引用1萬6千多次,H因子68。
許錦波,分子之心創(chuàng)始人,美國芝加哥豐田計算技術(shù)研究所終身教授
分子之心創(chuàng)始人,美國芝加哥豐田計算技術(shù)研究所教授、《Bioinformatics》編委、清華大學(xué)智能產(chǎn)業(yè)研究院(AIR)訪問學(xué)者,專注人工智能和計算生物學(xué)等研究方向的課題。
許錦波教授本科畢業(yè)于中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)計算機系,碩士畢業(yè)于中國科學(xué)院計算技術(shù)研究所,2003獲得加拿大滑鐵盧大學(xué)博士學(xué)位,而后進入美國麻省理工學(xué)院數(shù)學(xué)系和人工智能實驗室進行博士后工作,2022年回國創(chuàng)立公司分子之心。
許錦波教授的研究興趣包括人工智能和機器學(xué)習(xí)、優(yōu)化算法和計算生物學(xué)。他于2016年首次證明了深度學(xué)習(xí)可以大幅度提高蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測的性能,引領(lǐng)了人工智能在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測領(lǐng)域的突破。
許錦波教授曾獲美國斯隆研究獎、美國自然科學(xué)基金早期職業(yè)獎、《PLoS Computational Biology》創(chuàng)新突破獎、國際計算生物學(xué)頂級會議RECOMB最佳論文獎和時間檢驗獎 (Test-of-Time Award)。
薛貴榮,天壤創(chuàng)始人,CEO
天壤創(chuàng)始人、CEO,人工智能與大數(shù)據(jù)領(lǐng)域科學(xué)家、國家科技部云計算專家組成員、北航軟件學(xué)院大數(shù)據(jù)專業(yè)的特聘教授、KDD中國分會、CCF人工智能專委會、CCF大數(shù)據(jù)專委會委員、ACM WWW Internet Monetization領(lǐng)域主席。
薛貴榮博士于2006年獲得上海交通大學(xué)計算機博士學(xué)位,是首批全國優(yōu)秀博士論文獎獲得者。2006年至2009年,在上海交通大學(xué)計算機系擔任副教授、特別研究員。2009年加入阿里,擔任阿里媽媽大數(shù)據(jù)中心負責(zé)人和首席數(shù)據(jù)科學(xué)家。2016年創(chuàng)立天壤,帶領(lǐng)團隊先后在AI圍棋、交通、金融、生物等領(lǐng)域取得重要突破。
薛貴榮博士的研究方向,主要為機器學(xué)習(xí)、信息檢索、互聯(lián)網(wǎng)營銷、大規(guī)模數(shù)據(jù)分析和分布式計算,是國內(nèi)第一位在全球搜索領(lǐng)域頂級會議ACM SIGIR上發(fā)表論文的學(xué)者,曾在世界頂級會議NIPS、ICML、SIGKDD、SIGIR、WWW與世界頂尖刊物ACM TOIS、ACM TIST等發(fā)表論文70余篇,擁有專利十余項,論文引用達9000+。
主題:ChatGPT的一把火,能否燒到AI生命科學(xué)界?
時間:2月15日,北京時間20:00-22:00
主辦單位:雷峰網(wǎng) GAIR Live &《醫(yī)健AI掘金志》
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經(jīng)過幾年發(fā)展,GAIR大會已成為行業(yè)標桿,是目前為止粵港澳大灣區(qū)人工智能領(lǐng)域規(guī)模最大、規(guī)格最高、跨界最廣的學(xué)術(shù)、工業(yè)和投資領(lǐng)域盛會。
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