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本文作者: 劉海濤 | 2021-06-18 14:18 |
十一年前,張小龍找來10個開發(fā)員,在一間封閉開發(fā)的辦公室(被稱為“小黑屋”),開始沒日沒夜的開發(fā)微信;那一年,新浪成為了極少數(shù)主營業(yè)務(wù)轉(zhuǎn)型成功的互聯(lián)網(wǎng)企業(yè),新浪微博用戶基礎(chǔ)在一年時間就擴大了25倍之多。
從今天的成效來看,微信、新浪微博、小米、美團、陌陌等所有勇于選擇的創(chuàng)業(yè)者,在那一年都抓了最好的時代,收獲了自己的成功。
如今,同樣的故事或許正在生物制藥行業(yè)上演。
近期,雷鋒網(wǎng)《醫(yī)健AI掘金志》以“AI制藥·下一個現(xiàn)象級賽道”為主題,邀請了百圖生科、劑泰醫(yī)藥(METiS)、未知君、望石智慧、英矽智能、星藥科技等六家先鋒企業(yè),進行了一場線上云峰會分享。
此前,我們陸續(xù)推出五位嘉賓的演講精編:《百圖生科科學(xué)顧問高欣》;《未知君首席生信科學(xué)家胡函》;《望石智慧高級算法專家周文彪》;《英矽智能首席科學(xué)官任峰》;《星藥科技CEO李成濤》,感興趣的讀者可以拓展閱讀。
我們希望,通過見證這些最勇敢的創(chuàng)業(yè)者,能夠見證一個新賽道的崛起與未來。
作為該系列的最后一篇演講內(nèi)容,劑泰醫(yī)藥CEO賴才達圍繞新藥制劑開發(fā)談了很多自己的心得體會。
METiS 劑泰醫(yī)藥由AI藥物晶型研發(fā)公司晶泰科技孵化而來,公司繼承了晶泰科技的 AI 實力,并選擇聚焦于藥物遞送、制劑研發(fā)賽道,是全球首家以 AI 驅(qū)動的藥物制劑開發(fā)初創(chuàng)公司。
其可以為生物制藥公司提供制劑開發(fā)和優(yōu)化服務(wù),同時也會基于其專有的高通量 AI 制劑平臺搭建制劑新藥管線等。
他表示,現(xiàn)在越來越多新藥分子面臨制劑開發(fā)困難。
首先90%小分子本身就面臨藥物動力學(xué)問題,例如通透性差、溶解度差等現(xiàn)象,這都對最后成藥性造成極大影響。
其次就是新型態(tài)藥物(New Modalities),例如核酸藥物的靶向遞送,這更加考驗材料和制劑優(yōu)化方式。
開發(fā)者希望知道大分子結(jié)構(gòu)和不同輔料、納米材料如何交互作用,在不同生理微環(huán)境下條件,有什么樣物理和動力學(xué)性質(zhì)差異。
但迄今為止,基本沒有一個特別好的算法可以連接,微觀尺度分子及制劑交互作用和宏觀尺度藥物動力學(xué)性質(zhì)。
傳統(tǒng)的制劑開發(fā)手段,更像是手藝活,非常仰賴專家經(jīng)驗法則,專家依據(jù)分子預(yù)測其性質(zhì),做簡單試錯,能夠搜尋空間非常有限。
所以更需要AI來驅(qū)動新藥制劑開發(fā),幫助了解藥物遞送本質(zhì)以及原理和性質(zhì),進一步大幅提升藥物開發(fā)效率,提升傳統(tǒng)制劑開發(fā)手段。
在此背景下,劑泰醫(yī)藥推出了AI驅(qū)動制劑開發(fā)平臺AiTEM,其中包含可生成處方及工藝的大數(shù)據(jù)高通量藥物遞送及制劑平臺,以及以分子模擬及人工智能預(yù)測藥物物理及動力學(xué)性質(zhì)的計算平臺。
依托該平臺,劑泰在成立不到一年情況下,就相繼獲得華海藥業(yè)、博騰醫(yī)藥兩家知名上市藥企的合作支持。今年以來劑泰醫(yī)藥已經(jīng)累計完成了三輪融資,其中不乏紅杉資本中國、五源資本(原晨興資本)等知名 VC。
以下為賴才達演講內(nèi)容,《醫(yī)健AI掘金志》做了不改變原意的整理和編輯:
大家好,我是METiS劑泰醫(yī)藥CEO賴才達,非常高興分享我們的項目。
METiS致力于AI驅(qū)動新藥制劑開發(fā),尤其是drug delivery(藥物遞送)環(huán)節(jié)。
我們的愿景是致力于成為新藥遞送的設(shè)計師,其中主要包含以下三點:
通過提高BA、穩(wěn)定性來提升大、小分子成藥性;
改善藥物釋放控制,得到更好藥物效果;
通過新藥遞送系統(tǒng),設(shè)計臨床差異化制劑新藥,也就是505b2二類新藥。
公司最早由美國工程院院士創(chuàng)立技術(shù)構(gòu)想,并由晶泰科技孵化算法基礎(chǔ);
我們的目標是把高通量平臺產(chǎn)生的數(shù)據(jù)結(jié)合算法,去計算一個分子與成千上萬個分子之間的交互作用,最終把微觀尺度信息和宏觀尺度的物理動力學(xué)性質(zhì)關(guān)聯(lián)在一起。
通過這樣的構(gòu)想,我們完成了全世界第一個AI驅(qū)動新藥制劑以及藥物遞送開發(fā)平臺構(gòu)建。
目前,該平臺已經(jīng)推動幾種藥物開發(fā),從去年底開始到現(xiàn)在,已經(jīng)開發(fā)十幾個PCC項目,預(yù)計今年可以申報第一個IND,這也體現(xiàn)AiTEM平臺可以規(guī)模化,有效率產(chǎn)生臨床差異化管線。
今天主要介紹平臺技術(shù)機理,包括怎樣預(yù)測、設(shè)計、優(yōu)化制劑遞送材料,此外也會結(jié)合一些案例,通過平臺講解怎樣產(chǎn)生臨床差異化管線。
我們一般認為藥物遞送都是在小分子環(huán)節(jié),但目前提升藥物遞送已成為新一代藥物的核心部分。
例如PROTAC或核酸藥,這種新化學(xué)分子原件非常需要以遞送為核心手段去成藥。
此外,我們在開發(fā)平臺過程中,也發(fā)現(xiàn)很多傳統(tǒng)手段都需要革新。
傳統(tǒng)制劑開發(fā)手段,更像是手藝活,非常仰賴于專家經(jīng)驗法則,專家依據(jù)分子預(yù)測其性質(zhì),做簡單試錯,能夠搜尋的空間非常有限。
所以在這個環(huán)節(jié)中,AI制劑設(shè)計的價值會非常大,會從綠葉輔助陪伴成為真正的核心環(huán)節(jié)。
首先第一個價值點,505b2改良型新藥開發(fā)。
目前,美國已經(jīng)有很多藥企都在這方面投入,類似Reata, Recursion等公司就主要做藥物重定向、老藥新用開發(fā)。
劑泰打造的AiTEM平臺主要用于找尋老藥新用機會,滿足臨床缺陷,并進一步研究藥物PK、PD性質(zhì),在3~6個月內(nèi)完成立項到藥物制劑開發(fā)(非CMC工藝開發(fā))。
第二個價值點,新形態(tài)藥物核心環(huán)節(jié)藥物遞送,將藥物包裹在納米載體內(nèi),靶向遞送到對應(yīng)組織或靶向細胞中。
例如把mRNA、Base editor等復(fù)雜分子,高效送到特定細胞里,在這方面的材料設(shè)計,多元組份設(shè)計復(fù)雜度會大幅度提升,這也是我們的開發(fā)重點。
METiS是先從底層了解小分子藥物與輔料之間的交互作用,再進一步了解RNA、多肽、甚至抗體或蛋白等大分子與輔料之間的交互作用。
那我們是怎樣切入AI藥物遞送這一賽道的?
自己和團隊還在晶泰內(nèi)部時,就發(fā)現(xiàn)越來越多藥物分子,像NCE、多肽,或siRNA等復(fù)雜藥物分子,都面臨劑型開發(fā)困難。
光是小分子就有90%藥物面臨藥物動力學(xué)問題,例如通透性差、溶解度差等。
這都會對成藥性造成影響。相比藥物分子篩選,醫(yī)藥行業(yè)里面更加缺少一個更先進的藥物遞送工具。
在和很多大藥企合作的時候,他們經(jīng)常上來就問我們,是否可以設(shè)計一套計算工具用在開發(fā)環(huán)節(jié),從而實現(xiàn)知道分子結(jié)構(gòu)之后,即可快速了解其在不同輔料,不同工藝條件,不同環(huán)境下有怎樣的物理跟動力學(xué)性質(zhì)。
一開始我們運用傳統(tǒng)方法計算,例如CADD工具,試圖解釋一個分子在復(fù)雜輔料環(huán)境下,會有什么物理性質(zhì),但并沒有得到理想結(jié)果。
看到這個痛點之后,我們又是怎樣決定出來創(chuàng)業(yè)的?
傳統(tǒng)制劑開發(fā)過去非常仰賴專家經(jīng)驗,可能先是從單一材料或幾種材料結(jié)果去預(yù)測優(yōu)化條件,采用試錯方式,數(shù)量非常有限,搜尋空間也非常有限。
看到這個痛點之后,結(jié)合自己這么多年的AI學(xué)習(xí)和研發(fā)經(jīng)驗,我就問自己:“既然AI可以篩選分子結(jié)構(gòu)、進行疾病預(yù)測,那能不能應(yīng)用到藥物遞送環(huán)節(jié)當(dāng)中?!?/p>
剛開始有這個設(shè)想的時候,自己還比較緊張,因為我們看下來,光設(shè)計元件的選擇,載體參數(shù)設(shè)計,宏觀配方、處方工藝條件篩選,大概就有1010到1020以上設(shè)計空間。
在這么大挑戰(zhàn)下,最開始我們就透過AI把設(shè)計空間給框出來,然后用virtual screening(虛擬篩選)方式做初篩。
初篩完之后,再到高通量試驗平臺上做迭代,迭代結(jié)果重新輸入到AI系統(tǒng)以進一步優(yōu)化試驗,循環(huán)迭代試驗可以在數(shù)萬級數(shù)據(jù)空間內(nèi)大幅提升專家效率。
這種底層技術(shù)可以幫助我們了解藥在微環(huán)境下的性質(zhì),透過這個性質(zhì)再去預(yù)測,去優(yōu)化,就可以解決臨床上需要面臨的問題,跨維度、跨不同物理尺度優(yōu)化藥物制劑開發(fā)技術(shù)。
為什么除了我們還沒有任何一家AI公司布局這個方向?
其中最主要原因就是缺乏底層基礎(chǔ),也就是沒有公開大數(shù)據(jù)庫做 data training,現(xiàn)在公開數(shù)據(jù)庫大概只有幾千例數(shù)據(jù),很難做訓(xùn)練。
而且其還缺乏CADD量子力場計算工具、沒有高通量實驗平臺等,這些先天缺陷,讓其他企業(yè)沒有辦法驅(qū)動訓(xùn)練 AI學(xué)習(xí)系統(tǒng)。
從核心優(yōu)勢角度來講,劑泰主要完成三個核心技術(shù)突破:
(1) 高通量量子化學(xué)算法, 計算API分子與多元輔料交互作用;
(2) 高通量實驗?zāi)=M,針對各個劑型模擬藥物遞送的生產(chǎn)工藝及生理遞送微環(huán)境;
(3) AI算法完成虛擬篩選及優(yōu)化制劑設(shè)計及組合篩選。
通過計算及高通量實驗,完成迭代式學(xué)習(xí)推薦,最終生成制劑處方,完成后續(xù)的產(chǎn)品開發(fā),所以平臺是真正用數(shù)字化計算表征藥物的遞送平臺。
通過這樣的平臺,主要可以做三件事:
第一,分子成藥性優(yōu)化,通過制劑優(yōu)化即工藝處方優(yōu)化、提升創(chuàng)新分子結(jié)構(gòu)本身成藥性。
第二,藥物遞送系統(tǒng)(DDS)方案設(shè)計,透過我們平臺設(shè)計不同DDS方案,滿足臨床缺陷。
第三,老藥新用產(chǎn)品開發(fā),從立項到IND全流程開發(fā)平臺。
更具體地來說,第一個是成藥性優(yōu)化過程。
對每一個劑型里,每一個輔料進行解構(gòu),新分子進來后,和解構(gòu)單元體進行量子化學(xué)計算其交互作用,以此表征分子在該環(huán)境下的物理性質(zhì),快速篩選一個藥在新遞送條件的特征(Features)。
本來可能要花幾個月,甚至一年去完成的復(fù)雜計算,現(xiàn)在只要幾分鐘到一小時就可以完成,這是底層算法的一個重大突破。
以固體分散體為例,該劑型是透過無定形分子型態(tài)幫助藥物增溶。
在無定型狀態(tài)下,尋找高分子輔料加強藥物分子在Solid Dispersion下的穩(wěn)定狀態(tài),這樣可以避免藥物分子重新結(jié)晶,增加其溶解度,從而提高生物利用度。
其中最主要問題在于,需要知道藥物分子怎樣與各種高分子載體相互作用?
我們能夠了解最底層作用機制,在固分體里API分子怎么與載體交互作用,以及他們相互分布是什么樣子,從而預(yù)測藥物會不會穩(wěn)定,溶解度或溶出速率是否會提高。
其中固分體開發(fā)往往會面臨兩個矛盾,當(dāng)想提高固分體生物利用度時,需要化學(xué)勢能盡可能大,但當(dāng)API過飽和度時,又會增加API重結(jié)晶的風(fēng)險。
就像很多藥企在開發(fā)時遇到的困境,找到一種生物利用度很高的ASD,但在開發(fā)藥物臨床二期時,卻發(fā)現(xiàn)這種ASD不穩(wěn)定,再重新結(jié)晶會大幅度影響開發(fā)效率跟周期。
劑泰主要依據(jù)AI和計算平臺去預(yù)測化學(xué)勢能和穩(wěn)定性,虛擬篩選材料并進行處方及工藝條件優(yōu)化, 解決這類矛盾,設(shè)計不同高分子與藥物組分,提升他的driving force,然后又能夠提升穩(wěn)定活化能。
我們在實際反應(yīng)條件里做ASD成分優(yōu)化,大家也知道這個篩選過程很艱難,運用高分子載體數(shù)據(jù)庫,選擇合適試劑,然后通過高通量訓(xùn)練,構(gòu)建AI模型或分子模擬進行預(yù)測。
整個過程中確實是可以找到一些非常有趣的結(jié)果,除了預(yù)測穩(wěn)定性之外,甚至可以找到非常多,專家找不到的處方條件,從而幫助專家突破本來trial-and-error和靠經(jīng)驗法則時的決策誤區(qū)。
以上就是我們核心的優(yōu)勢,對非線性數(shù)據(jù)進行歸納整理,建立預(yù)測能力幫助輔料優(yōu)化及多元輔料篩選,甚至工藝條件篩選,進而優(yōu)化藥物載藥量,溶出條件,穩(wěn)定性等。
從簡單液體制劑,到固體分散體,直壓,甚至更復(fù)雜微球、透皮,這種大分子利用平臺聚合物膠束/脂質(zhì)納米粒等等。
在這一系列都可以從這些底層交互作用去做材料設(shè)計,甚至新材料設(shè)計來做DDS技術(shù)優(yōu)化。
就像我前面介紹,DDS是未來開發(fā)新藥非常重要的一個方向,不管我們做制劑開發(fā)、還是小分子藥物遞送、mRNA藥物遞送,如果有能力破解這些底層遞送核心問題,就可以滿足專家非常難優(yōu)化的這些條件。
當(dāng)我們把DDS解決之后,結(jié)合老藥新用平臺,開發(fā)滿足臨床需求的產(chǎn)品,才是我們真正的初衷。
與505b1創(chuàng)新藥不一樣,505b2不需改變分子本身結(jié)構(gòu),通過改變遞送方式或適應(yīng)癥方向從而滿足臨床缺陷,就可以明顯提高成藥成功率。
我們希望可以快速實現(xiàn)立項到臨床驗證的閉環(huán),從而實現(xiàn)閉環(huán)學(xué)習(xí)過程。
整個AiTEM平臺搭建基本就是從臨床開始,挖掘大量數(shù)據(jù),找出不同適應(yīng)癥領(lǐng)域藥物開發(fā)機會,如CNS、慢性腎病、代謝性疾病、疼痛性疾病、甚至是許多腫瘤性疾病。
開發(fā)思路有兩種,
一種是跟遞送相關(guān),例如減毒增效,提升病人依從性;
二是改變適應(yīng)癥,解決無藥可用的問題,從立項一路到POC,大概3~6個月就可以完成。
以抗癌的一線用藥紫杉醇為例,因為本身可溶性和成藥性問題,原研使用蓖麻油衍生物,存在一定過敏性問題。雷鋒網(wǎng)
我們嘗試去掉不良條件,透過簡單制劑來滿足成藥性質(zhì),實現(xiàn)雙倍劑量,達到減毒增效作用,最終目標是讓毒性和工藝成本都明顯降低。
通過機器學(xué)習(xí)、強化學(xué)習(xí)方法,最終篩選大概到106次到107設(shè)計空間,做全局優(yōu)化,這種數(shù)量已經(jīng)遠遠超過目前專家能力,在大的設(shè)計空間中找到最優(yōu)條件,再做動物試驗,得到很好結(jié)果。
其實,劑泰不僅做制劑開發(fā)的效率提升,更多是透過搜尋能力提升之后,找到專家找不到的成藥機會。
我們的愿景也是成為一個擁有算法平臺+高通量試驗平臺+立項平臺+管線轉(zhuǎn)化平臺的生物科技企業(yè)。
今天非常高興介紹我們的項目,AI drug delivery是一種顛覆性技術(shù),通過這樣手段可以初步從小分子藥布局進行改良性新藥開發(fā),下一步將開發(fā)具有靶向作用的核酸技術(shù)平臺,把更多好藥提供給患者。雷鋒網(wǎng)
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