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劍指LightGBM和XGboost!斯坦福發(fā)表NGBoost算法

本文作者: skura 2019-11-18 18:29
導語:與 LightGBM 和 GBoost 比較,它是否具有優(yōu)勢?

劍指LightGBM和XGboost!斯坦福發(fā)表NGBoost算法

James Pond 在 Unsplash 雜志上的照片

Stanford ML Group 最近在他們的論文中發(fā)表了一個新算法,其實現(xiàn)被稱為 NGBoost。該算法利用自然梯度將不確定性估計引入到梯度增強中。本文試圖了解這個新算法,并與其他流行的 boosting 算法 LightGBM 和 XGboost 進行比較,以了解它在實踐中是如何工作的。

注:Stanford ML Group 發(fā)表的論文網(wǎng)址為:https://arxiv.org/abs/1910.03225,有興趣的同學可以下載學習~

本文的主要內(nèi)容包括以下三個部分:

  1. 什么是自然梯度增強?

  2. 經(jīng)驗驗證——與 LightGBM 和 XGBoost 的比較

  3. 結(jié)論

1.什么是自然梯度增強?

正如我在簡介中所寫那樣,NGBoost 是一種新的 boosting 算法,它使用自然梯度 boosting,是一種用于概率預測的模塊化 boosting 算法。該算法由 Base learners 、參數(shù)概率分布和評分規(guī)則組成。我將簡要地解釋一下這些術(shù)語是什么。

劍指LightGBM和XGboost!斯坦福發(fā)表NGBoost算法

  • Base learners

該算法使用 Base learners。它接受輸入 x,輸出用來形成條件概率。這些 Base learners 使用 scikit-learn 的決策樹作為樹型學習者,使用嶺回歸作為線性學習者。

  • 參數(shù)概率分布

參數(shù)概率分布是一種條件分布。這是由 Base learners 輸出的加法組合形成的。

  • 評分規(guī)則

評分規(guī)則采用預測的概率分布和對目標特征的觀察來對預測結(jié)果進行評分,真實的結(jié)果分布期望值得到最好的分數(shù)。該算法使用最大似然估計(MLE)或 CRPS(連續(xù)排序概率得分)。

我們剛剛介紹了 NGBoost 的基本概念。我建議你閱讀原稿以便進一步理解(用數(shù)學符號更容易理解算法)。

2.經(jīng)驗驗證:與 LightGBM 和 XGBoost 的比較

劍指LightGBM和XGboost!斯坦福發(fā)表NGBoost算法

billy lee 在 Unsplash 雜志上的照片

讓我們實現(xiàn) NGBoost,看看它的性能如何。論文還對各種數(shù)據(jù)集進行了實驗。他們比較了 MC-dropout、Deep-Ensembles 和 NGBoost 在回歸問題中的表現(xiàn),NGBoost 表現(xiàn)出了很強的競爭力。在這篇博文中,我想展示一下這個模型在 Kaggle 上著名的房價預測數(shù)據(jù)集上的性能。這個數(shù)據(jù)集包含 81 個特征,1460 行,目標是預測銷售價格。讓我們看看 NGBoost 如何處理這些情況。

劍指LightGBM和XGboost!斯坦福發(fā)表NGBoost算法

目標特征的分布

由于測試算法的性能是本文的目的,我們將跳過整個特征工程部分,并將使用 Nanashi 的解決方案。

導入包:

# import packages

import pandas as pd


from ngboost.ngboost import NGBoost

from ngboost.learners import default_tree_learner

from ngboost.distns import Normal

from ngboost.scores


import MLE import lightgbm as lgb


import xgboost as xgb


from sklearn.model_selection import train_test_split

from sklearn.metrics import mean_squared_error

from math import sqrt

在這里,我將使用上面的默認學習者、分布和評分規(guī)則,看看結(jié)果如何變化。

# read the dataset

df = pd.read_csv('~/train.csv')


# feature engineering

tr, te = Nanashi_solution(df)




現(xiàn)在使用 NGBoost 算法進行預測。

# NGBoost

ngb = NGBoost(Base=default_tree_learner, Dist=Normal, Score=MLE(),

natural_gradient=True,verbose=False)


ngboost = ngb.fit(np.asarray(tr.drop(['SalePrice'],1)),

np.asarray(tr.SalePrice))


y_pred_ngb = pd.DataFrame(ngb.predict(te.drop(['SalePrice'],1)))




對 LightGBM 和 XGBoost 也做一樣的事情:

# LightGBM

ltr = lgb.Dataset(tr.drop(['SalePrice'],1),label=tr['SalePrice'])


param = {

'bagging_freq': 5,

'bagging_fraction': 0.6,

'bagging_seed': 123,

'boost_from_average':'false',

'boost': 'gbdt',

'feature_fraction': 0.3,

'learning_rate': .01,

'max_depth': 3,

'metric':'rmse',

'min_data_in_leaf': 128,

'min_sum_hessian_in_leaf': 8,

'num_leaves': 128, 'num_threads': 8,

'tree_learner': 'serial',

'objective': 'regression',

'verbosity': -1,

'random_state':123,

'max_bin': 8,

'early_stopping_round':100

}


lgbm = lgb.train(param,ltr,num_boost_round=10000,valid_sets= [(ltr)],verbose_eval=1000)


y_pred_lgb = lgbm.predict(te.drop(['SalePrice'],1))

y_pred_lgb = np.where(y_pred>=.25,1,0)


# XGBoost

params = {

'max_depth': 4, 'eta': 0.01,

'objective':'reg:squarederror',

'eval_metric': ['rmse'],

'booster':'gbtree',

'verbosity':0,

'sample_type':'weighted',

'max_delta_step':4,

'subsample':.5,

'min_child_weight':100,

'early_stopping_round':50

}


dtr, dte = xgb.DMatrix(tr.drop(['SalePrice'],1),label=tr.SalePrice),

xgb.DMatrix(te.drop(['SalePrice'],1),label=te.SalePrice)


num_round = 5000

xgbst = xgb.train(params,dtr,num_round,verbose_eval=500)


y_pred_xgb = xgbst.predict(dte)

現(xiàn)在我們用所有算法進行了預測。讓我們檢查一下它們的準確性。我們將使用與這次 kaggle 競賽相同的標準,RMSE。

# Check the results

print('RMSE: NGBoost',

round(sqrt(mean_squared_error(X_val.SalePrice,y_pred_ngb)),4))

print('RMSE: LGBM',

round(sqrt(mean_squared_error(X_val.SalePrice,y_pred_lgbm)),4))

print('RMSE: XGBoost',

round(sqrt(mean_squared_error(X_val.SalePrice,y_pred_xgb)),4))

以下是預測結(jié)果的總結(jié)。

劍指LightGBM和XGboost!斯坦福發(fā)表NGBoost算法

預測結(jié)果總結(jié)

看來 NGBoost 的性能優(yōu)于其他著名的 boosting 算法。公平地說,我覺得如果我調(diào)整 BGBoost 的參數(shù),它會更好。

NGBoost 與其他 boosting 算法最大的區(qū)別之一是可以返回每個預測的概率分布。這可以通過使用 pred_dist 函數(shù)可視化。此函數(shù)能夠顯示概率預測的結(jié)果。

# see the probability distributions by visualising

Y_dists = ngb.pred_dist(X_val.drop(['SalePrice'],1))

y_range = np.linspace(min(X_val.SalePrice), max(X_val.SalePrice), 200)

dist_values = Y_dists.pdf(y_range).transpose()


# plot index 0 and 114

idx = 114

plt.plot(y_range,dist_values[idx])

plt.title(f"idx: {idx}")

plt.tight_layout()

plt.show()

劍指LightGBM和XGboost!斯坦福發(fā)表NGBoost算法

概率分布示例

上面的圖表是每個預測的概率分布。X 軸顯示銷售價格的日志值(目標特征)。我們可以觀察到,指數(shù) 0 的概率分布比指數(shù) 114 的更寬。

結(jié)論與思考

從實驗結(jié)果可以看出,NGBoost 算法與其他著名的 boosting 算法具有相同的性能。然而,計算時間比其他兩種算法要長得多。這可以通過使用子采樣方法來改進。此外,在我的印象中,NGBost 包仍在開發(fā)中,例如,沒有提前停止選項,沒有顯示中間結(jié)果的選項,選擇 Base leaners 的靈活性(到目前為止,我們只能在決策樹和嶺回歸之間選擇),設置一個隨機狀態(tài)種子,等等。我相信這些要點將很快得到落實。

你也可以在我的 GitHub 頁面上找到我在這篇文章中使用的代碼:https://github.com/kyosek/NGBoost-experiments 

總結(jié)

  • NGBoost 是一種返回概率分布的 boosting 算法。

  • 自然梯度增強,一種用于概率預測的模塊化增強算法。這包括 Base leaners、參數(shù)概率分布和評分規(guī)則。

  • NGBoost 預測與其他流行的 boosting 算法相比具有很大的競爭力。

參考文獻:

[1] T. Duan, et al., NGBoost: Natural Gradient Boosting for Probabilistic Prediction (2019), ArXiv 1910.03225

via:https://towardsdatascience.com/ngboost-explained-comparison-to-lightgbm-and-xgboost-fda510903e53

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