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本文作者: 喬燕薇 | 2023-06-27 14:22 |
“我們不會去做CRO或自研管線,華為云的優(yōu)勢在云、大數(shù)據(jù)和AI這些軟件領(lǐng)域,不可能像創(chuàng)業(yè)公司一樣招聘很多生物醫(yī)藥背景的人做Biotech,我們也沒有這樣的基因?!?br/>
“IT領(lǐng)域面向醫(yī)療行業(yè)的產(chǎn)品和解決方案非常少,沒有很好的產(chǎn)品或工具能夠系統(tǒng)地解決醫(yī)療行業(yè)中存在的問題。醫(yī)療是一個非常細(xì)分且瑣碎的行業(yè),做起來又特別難,科技公司在這個領(lǐng)域的投入是不夠的?!?br/>
近日,雷峰網(wǎng)《醫(yī)健AI掘金志》推出《AI制藥十人談》系列,探究AI制藥的前景與隱憂。
華為云醫(yī)療產(chǎn)品總監(jiān),醫(yī)療首席科學(xué)家喬楠博士在與《醫(yī)健AI掘金志》的對話中,談到了他對醫(yī)療行業(yè)產(chǎn)品與服務(wù)情況的觀察。
喬楠是AI制藥領(lǐng)域中少有的具有綜合背景的研究者,2013年博士畢業(yè)于中國科學(xué)院后,喬楠進(jìn)入諾華制藥,從事生物信息學(xué)分析工作,參與抗癌藥物的研發(fā)。在諾華制藥工作期間,還曾獲得諾華團(tuán)隊合作獎和諾華優(yōu)選獎。
2015年喬楠加入埃森哲并領(lǐng)導(dǎo)成立了埃森哲中國AILab,為不同行業(yè)提供的客戶提供產(chǎn)品和解決方案。在埃森哲工作期間,喬楠發(fā)現(xiàn),IT領(lǐng)域面向醫(yī)療行業(yè)的產(chǎn)品和解決方案還不夠豐富,這一領(lǐng)域仍有待大力發(fā)掘。
2018年,華為公開發(fā)布全棧全場景AI框架,搭建起了建設(shè)AI To B業(yè)務(wù)的重要基礎(chǔ),喬楠決定加入華為,重新回到制藥行業(yè)。
在埃森哲的工作經(jīng)驗,讓喬楠更加了解不同行業(yè)之間的壁壘,熟練掌握如何使用數(shù)據(jù)庫、AI等前沿技術(shù)解決行業(yè)難題。
加入華為云后,喬楠面臨的首要任務(wù)就是打造一個面向醫(yī)療行業(yè)的AI研發(fā)平臺,喬楠和團(tuán)隊選定基因組、藥物研發(fā)和臨床研究三個方向作為重點,構(gòu)建起面向醫(yī)療行業(yè)的AI和大數(shù)據(jù)能力。
依托于華為云自主研發(fā)的盤古藥物分子大模型,聯(lián)合中科院上海藥物研究所的蔣華良院士、北京大學(xué)的高毅勤教授等業(yè)內(nèi)專家,醫(yī)療團(tuán)隊打造了制藥行業(yè)的EDA軟件:盤古輔助制藥平臺,為藥物研發(fā)機(jī)構(gòu)提供SaaS化軟件服務(wù)。
喬楠指出,藥物設(shè)計平臺的基礎(chǔ)建設(shè)不是一兩家企業(yè)獨自能夠完成的,只有國內(nèi)的科技企業(yè)與科研機(jī)構(gòu)一起發(fā)力,持續(xù)打造出自己的軟件生態(tài),才能避免被國外“卡脖子”。
以下為《醫(yī)健AI掘金志》與喬楠的對話內(nèi)容,《醫(yī)健AI掘金志》做了不改變原意的編輯與整理。
《醫(yī)健AI掘金志》:您博士畢業(yè)于中國科學(xué)院生物信息學(xué)專業(yè),當(dāng)時的研究方向是什么?什么時候開始接觸藥物研發(fā)?
喬楠:我本科學(xué)的是自動化,后來轉(zhuǎn)到生物技術(shù)專業(yè),博士期間選擇了生物信息學(xué),師從分子系統(tǒng)生物學(xué)專家韓敬東教授。
生物信息學(xué)本身是一個交叉學(xué)科,我們需要把生物學(xué)、數(shù)學(xué)、計算機(jī)、物理、化學(xué)等等很多領(lǐng)域的知識整合起來,運用在生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的數(shù)據(jù)分析中,構(gòu)建機(jī)器學(xué)習(xí)的模型或深度學(xué)習(xí)模型,用來驗證科學(xué)家提出的生物學(xué)假設(shè)。
研究的內(nèi)容上,我做的比較雜,比如通過文本挖掘,分析文獻(xiàn)中基因的信息;通過分析蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)的數(shù)據(jù),尋找潛在藥物的靶點;還有針對基因組數(shù)據(jù)的各種分析和建模,博士期間的一個工作就是分析 家蠶被病毒侵染之后基因表達(dá)量的變化。
另一個比較有意思的工作叫做“WormFarm”。 Worm就是是線蟲,是一種常用的模式生物 ,F(xiàn)arm是農(nóng)場,代表我們實驗室研發(fā)的一種微流控芯片。
我們在指甲蓋大小的微流控芯片上刻 8 個小槽,將很小的線蟲養(yǎng)在其中,每天喂食營養(yǎng)液,讓它們在芯片里生長,通過設(shè)計各種實驗觀察線蟲的表型,比如對線蟲的基因進(jìn)行敲除之后觀察線蟲的生存時間,通過這些觀察建立起長壽與基因相關(guān)的模型,尋找長壽基因與藥物靶點。
《醫(yī)健AI掘金志》:博士畢業(yè)后,您曾在諾華制藥工作過一段時間,您在這一階段專注于哪些研究工作?那一時期AI制藥技術(shù)的發(fā)展情況如何?
喬楠:讀博期間,我做了很多科研數(shù)據(jù)分析,畢業(yè)之后希望能夠進(jìn)入具體的行業(yè)中,看看大家如何用機(jī)器學(xué)習(xí)、數(shù)據(jù)分析這些技術(shù)解決業(yè)務(wù)問題,于是加入了諾華制藥在張江藥谷建立的研究所。
進(jìn)入諾華制藥后,我主要從事生物信息學(xué)分析工作,分析病人樣本、動物模型、細(xì)胞系等不同維度的多組學(xué)數(shù)據(jù)。通過對多組學(xué)數(shù)據(jù)的分析,找到可能的生物標(biāo)記物或潛在的藥物靶點。同時也對實驗團(tuán)隊的數(shù)據(jù)進(jìn)行分析和建模,指導(dǎo)他們做早期的藥物發(fā)現(xiàn)。
我在諾華制藥工作期間,深度學(xué)習(xí)才興起不久,ImageNet等相關(guān)工作才剛剛發(fā)表,藥物設(shè)計還處于CADD階段(計算機(jī)輔助藥物設(shè)計),藥企開始使用計算機(jī)軟件和算法對藥物進(jìn)行輔助設(shè)計和計算模擬優(yōu)化,如今興起的AIDD,也是起源于CADD,對于CADD的一些問題,AI的算法可以做到更好。
《醫(yī)健AI掘金志》:您為什么選擇加入華為云,擔(dān)任醫(yī)療產(chǎn)品總監(jiān)及醫(yī)療首席科學(xué)家?加入華為云后您帶領(lǐng)醫(yī)療團(tuán)隊進(jìn)行了哪些工作?
喬楠:在諾華制藥工作習(xí)慣后,我發(fā)現(xiàn)日常進(jìn)行的大多是重復(fù)性的工作,我想要看一看在更多的行業(yè)中大家如何借助機(jī)器學(xué)習(xí)處理相關(guān)業(yè)務(wù),于是在2015年,我加入埃森哲,擔(dān)任埃森哲中國首席數(shù)據(jù)科學(xué)家,并領(lǐng)導(dǎo)成立了埃森哲中國AILab,面向不同行業(yè)的客戶提供AI產(chǎn)品和解決方案。
在這個過程中,我發(fā)現(xiàn)IT領(lǐng)域面向醫(yī)療行業(yè)的產(chǎn)品和解決方案非常少,沒有很好的產(chǎn)品或工具能夠系統(tǒng)地解決醫(yī)療行業(yè)中存在的問題。醫(yī)療是一個非常細(xì)分且瑣碎的行業(yè),做起來又特別難,科技公司在這個領(lǐng)域的投入是不夠的。
另一方面,2018年,華為的輪值董事長徐直軍發(fā)布了全棧全場景的AI框架,這是建設(shè)AI ToB業(yè)務(wù)的重要基礎(chǔ),一個企業(yè)如果想要從頭構(gòu)建AI 平臺,就必須要有一套全棧全場景的AI平臺和解決方案。
在2018年,全球只有谷歌一家公司有這樣的全棧全場景能力,先后發(fā)布過Tensorflow、TPU、Google Cloud等產(chǎn)品和平臺。
當(dāng)我看到華為發(fā)布了完全國產(chǎn)的全棧全場景AI框架時,覺得這是一個非常有前瞻性、非常重要工作,于是決定加入華為云,重新回到醫(yī)療行業(yè)。
在埃森哲的工作經(jīng)歷對我回到醫(yī)療行業(yè)后的工作幫助很大,讓我了解了不同行業(yè)之間的壁壘,如何使用數(shù)據(jù)庫、AI等前沿技術(shù)解決行業(yè)難題,將不同的技能串聯(lián)起來,這是很多生物醫(yī)藥背景出身的從業(yè)者缺乏的能力。
我加入華為之后,首要的任務(wù)是打造一個面向醫(yī)療行業(yè)的AI研發(fā)平臺。
對于任何企業(yè)來說這都是一個難題,大部分傳統(tǒng)行業(yè)的公司缺乏云、大數(shù)據(jù)、AI背景的人才,很難快速地構(gòu)建起一個AI研發(fā)平臺,沒有AI研發(fā)平臺公司就很難快速進(jìn)行研發(fā)創(chuàng)新。
所以,我們希望實現(xiàn)的效果是,用戶只要在云平臺上創(chuàng)建一個賬號,訂閱相關(guān)的服務(wù),就能夠借助平臺的支持進(jìn)行AI 研發(fā)工作。
醫(yī)療行業(yè)的細(xì)分領(lǐng)域非常多,華為云究竟要構(gòu)建什么樣的平臺?這也是一個很緊要的問題。
我們對醫(yī)療行業(yè)進(jìn)行了系統(tǒng)的分析和洞察,最終決定選擇三個方向作為工作的重點,基因組、藥物研發(fā)和臨床研究。
圍繞著這三個方向,我們構(gòu)建起基礎(chǔ)的AI和大數(shù)據(jù)能力,同時,聯(lián)合華為云的技術(shù)合作伙伴,高校和中科院研究所共同研發(fā),開發(fā)了這些領(lǐng)域中核心的技術(shù)和算法,將其產(chǎn)品化后放到平臺上,供醫(yī)療行業(yè)的研發(fā)人員使用。
在一次研討中,中科院上海藥物研究所的蔣華良院士,北京大學(xué)的來魯華教授、高毅勤教授、李洪林教授等業(yè)內(nèi)專家,提到大家在藥物研發(fā)領(lǐng)域涉及到的物理化學(xué)、量子力學(xué)、量子化學(xué)、結(jié)構(gòu)生物學(xué)等諸多基礎(chǔ)學(xué)科中分別有各自擅長的方向,但教授們開發(fā)的算法或工具,往往幾年后就不再進(jìn)行維護(hù)了,缺少連續(xù)性。
我們希望和這些教授合作起來,打造出一套完全自主可控的AI 輔助藥物設(shè)計平臺。
《醫(yī)健AI掘金志》:SaaS、AI CRO與AI Biotech,是AI制藥領(lǐng)域的三種主要商業(yè)模式,華為云在打造AI輔助藥物設(shè)計服務(wù)平臺時,是如何在這三者中進(jìn)行選擇的?
喬楠:華為云提供的是SaaS化的軟件服務(wù),企業(yè)注冊賬號后,開通相關(guān)服務(wù)即可使用。我們的盤古輔助藥物設(shè)計平臺是依托華為云平臺打造的,華為云主要為企業(yè)提供IT數(shù)字化和智能化的服務(wù),旗下的研發(fā)人員多為算法工程師、軟件工程師,軟件和算法是我們的優(yōu)勢,平臺本身的定位就是藥物設(shè)計軟件,通過SaaS化的方式向藥物研發(fā)機(jī)構(gòu)提供服務(wù)。
我們不會去做CRO或自研管線,華為云的優(yōu)勢在云、大數(shù)據(jù)和AI這些軟件領(lǐng)域,不可能像創(chuàng)業(yè)公司一樣招聘很多生物醫(yī)藥背景的人做Biotech,我們也沒有這樣的基因。
《醫(yī)健AI掘金志》:盤古藥物分子大模型能夠賦能新藥研發(fā)流程中的哪些工作?
喬楠:我們的AI輔助藥物研發(fā)平臺能夠覆蓋藥物設(shè)計的全流程,為靶點發(fā)現(xiàn)、藥物篩選、分子優(yōu)化三個環(huán)節(jié)提供強(qiáng)力支撐。
在靶點發(fā)現(xiàn)環(huán)節(jié),2019年以來,我們針對基因數(shù)據(jù)、基因多組學(xué)數(shù)據(jù)、基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)陸續(xù)發(fā)布了三個算法:AutoGenome、AutoOmics、AutoGGN,通過從細(xì)胞系、動物模型、病人身體組織中測到的多組學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行AI建模,為生物標(biāo)記物發(fā)現(xiàn)和靶點發(fā)現(xiàn)等相關(guān)問題提供依據(jù)。
我們聯(lián)合北京大學(xué)高毅勤教授團(tuán)隊開發(fā)的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測算法MEGA-Protein,可以根據(jù)已有的蛋白質(zhì)序列出蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu);
獲取蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)以后,下一個任務(wù)就是基于元動力學(xué)進(jìn)行靶點發(fā)現(xiàn)與構(gòu)象搜索,找到靶點與配體的可能的結(jié)合位置;
我們從軟件和硬件層次對分子動力學(xué)模擬工具進(jìn)行了大幅提升,使計算時間得以縮短。
在藥物篩選環(huán)節(jié),我們打造了一個獨有的小分子庫生成功能,基于盤古藥物分子大模型,從模型學(xué)習(xí)到的類藥化學(xué)空間中均衡采樣,生成新穎且類藥性質(zhì)更優(yōu)的化合物分子庫,幫助加速藥物篩選過程。
獲得新穎的小分子庫后,可以進(jìn)行小分子藥物虛擬篩選,這也是CADD中最典型的一個功能,除小分子外,平臺同樣支持多肽分子的虛擬篩選。
在分子優(yōu)化環(huán)節(jié),分子搜索功能基于華為云盤古藥物分子大模型的小分子化合物表征,以使用者輸入的參考化合物結(jié)構(gòu)為起點,從海量的小分子庫中搜索到相似結(jié)構(gòu)和排序,可以實現(xiàn)百億級小分子的秒級搜索。
分子屬性預(yù)測也是藥物研發(fā)中的重要一環(huán),藥物分子設(shè)計完成后,不經(jīng)過實驗驗證就無法了解化合物的性質(zhì)。盤古藥物分子大模型能夠預(yù)測化合物的ADMET/PKPD相關(guān)的80多種成藥性質(zhì),給出預(yù)測值與置信度。
分子優(yōu)化功能是AI輔助藥物設(shè)計中最核心的功能,不論是創(chuàng)新藥還是Me-too、Me-better,都要基于前期的分子進(jìn)行改造。使用者在平臺中輸入一個分子,指定其結(jié)合口袋、分子屬性、分子結(jié)構(gòu)等,即可對分子進(jìn)行定向優(yōu)化,我們支持針對70余種分子屬性的多目標(biāo)優(yōu)化。
《醫(yī)健AI掘金志》:數(shù)據(jù)問題一直是AI制藥領(lǐng)域的痛點,已經(jīng)成為目前制約AI藥物研發(fā)的重要因素之一。華為云為獲取和積累藥物數(shù)據(jù)做了哪些工作?AI制藥應(yīng)如何打破數(shù)據(jù)孤島?
喬楠:華為云盤古藥物分子大模型共學(xué)習(xí)了17億個小分子的化學(xué)結(jié)構(gòu)。
在藥物設(shè)計領(lǐng)域,尤其是小分子領(lǐng)域,學(xué)術(shù)界有很多開源的數(shù)據(jù)庫可以使用,我們收集的17億個小分子化合物全部源于開源信息,我們聯(lián)合中科院上海藥物研究所蔣華良院士團(tuán)隊共同完成了盤古藥物分子大模型的訓(xùn)練。
在訓(xùn)練盤古藥物分子大模型時,我們采用了無監(jiān)督學(xué)習(xí)的方法,只需要化合物的信息,不需要實驗數(shù)據(jù)。在學(xué)習(xí)了這17億個小分子化合物后,已經(jīng)能夠讓大模型比較好地學(xué)習(xí)到小分子化合物隱含的表征空間。
另一方面,藥物設(shè)計是一個非常微觀的過程,小分子化合物、蛋白等都是微觀層次下的結(jié)構(gòu)和狀態(tài)。我們可以借助分子動力學(xué)模擬等軟件和工具,通過計算和模擬的方法去產(chǎn)生大量的數(shù)據(jù),這些數(shù)據(jù)也可以應(yīng)用到大模型的訓(xùn)練之中。
實驗數(shù)據(jù)是藥企的重要資產(chǎn),一般無法輕易獲取,數(shù)據(jù)共享是一個很難的問題,近年來業(yè)內(nèi)在藥物數(shù)據(jù)共享上做了很多工作,但收效甚微,短期內(nèi)這一問題都難以解決。
我們能做的就是將盤古藥物分子大模型開放給藥企,讓藥企可以基于自己的數(shù)據(jù)再加上盤古藥物分子大模型調(diào)優(yōu)自己的模型,用于藥物管線的分子設(shè)計與優(yōu)化。
當(dāng)藥企的研發(fā)工作結(jié)束,不再使用這個平臺,就可以將自己的數(shù)據(jù)和模型完全刪除,避免泄露。
《醫(yī)健AI掘金志》:隨著AI制藥技術(shù)的不斷成熟,近年來業(yè)內(nèi)涌現(xiàn)了一批AI制藥初創(chuàng)企業(yè),互聯(lián)網(wǎng)、科技巨頭在該領(lǐng)域也多有布局。在眾多競爭者之中,盤古藥物分子大模型有哪些差異化優(yōu)勢?
喬楠:我們希望國內(nèi)的科技公司、初創(chuàng)企業(yè)不斷在AI制藥這一領(lǐng)域加大投入,雖然中國的AI制藥行業(yè)發(fā)展得很好,但目前行業(yè)內(nèi)處于最尖端的仍是歐美國家。這個領(lǐng)域本身就具有很高的難度,只有大家都投入進(jìn)來,才能讓中國吃到這一波紅利。
華為在云、大數(shù)據(jù)和AI領(lǐng)域有很深的基礎(chǔ),我們具備建設(shè)基礎(chǔ)平臺的能力,同時也具備一些核心的技術(shù)優(yōu)勢,比如華為云自主提出了一套全新的深度學(xué)習(xí)架構(gòu),這是我們專門針對小分子化合物的性質(zhì)設(shè)計的一套架構(gòu),能夠更好地學(xué)習(xí)小分子化合物的深度表征,是盤古藥物分子大模型的核心,決定了大模型的性能和效果。
此外,在AI輔助藥物設(shè)計平臺的產(chǎn)品設(shè)計上,我們每年會進(jìn)行數(shù)十次的迭代升級,不斷引入新的技術(shù)和方法,并且會吸收用戶提出的建議對產(chǎn)品進(jìn)行改進(jìn)和迭代。
《醫(yī)健AI掘金志》:針對國內(nèi)創(chuàng)新藥研發(fā)現(xiàn)狀,目前還是Fast Follow居多,或者是Me-too、Me-better,這種情況下最需要AI去解決什么問題?
以華為為代表的大型科技公司的入局,將如何推動國內(nèi)創(chuàng)新藥的發(fā)展,優(yōu)化行業(yè)生態(tài)?下一步,華為云將在藥物研發(fā)領(lǐng)域進(jìn)行哪些新的布局?
喬楠:當(dāng)前國內(nèi)情況肯定是Me-too、Me-better更多,但是這不是個大問題,比如我們的分子優(yōu)化工具可以基于Fast Follow分子直接進(jìn)行改造優(yōu)化,如果優(yōu)化的結(jié)果更好,就是Me better藥物了。所以目前的重點是如何讓藥企的研發(fā)人員更快、更好地掌握AI工具的使用。
在藥物設(shè)計這個領(lǐng)域,國內(nèi)外的藥企如今應(yīng)用最多的還是國外的CADD軟件,如薛定諤、MOE等,我們希望中國的科技公司在領(lǐng)域內(nèi)不斷投入,構(gòu)建起國產(chǎn)的藥物設(shè)計平臺與生態(tài)。
這個過程中,必然會涉及到很多基礎(chǔ)能力建設(shè),絕非是一兩家公司獨自就能夠解決的,只有國內(nèi)的科技公司、科研機(jī)構(gòu)等一起發(fā)力,打造出自己的軟件生態(tài),才能夠不斷地升級迭代,優(yōu)化藥物設(shè)計各類工具,提升能力,避免被國外“卡脖子”。
創(chuàng)新藥研發(fā)的核心在于生物技術(shù)實驗的驗證,而AI和BT的融合將會起到1+1大于2的效果,下一階段,我們將會進(jìn)一步推進(jìn)對AI+BT的融合的制藥平臺研究。同時,圍繞藥物設(shè)計軟件的更多領(lǐng)域進(jìn)行布局,希望能夠支持更多類型的藥物研發(fā)。
作為一個開放的平臺,我們也支持第三方工具通過華為云向藥企提供服務(wù),做好產(chǎn)業(yè)鏈的協(xié)同發(fā)展,與下游伙伴更好地合作,共同推動制藥產(chǎn)業(yè)的創(chuàng)新與變革。
《醫(yī)健AI掘金志》:盤古藥物分子大模型目前已經(jīng)支撐了多家藥企和科研院的商業(yè)服務(wù)或藥物管線開發(fā)合作,其中有哪些典型案例?
喬楠:我們聯(lián)合西安交通大學(xué)第一附屬醫(yī)院的劉冰教授團(tuán)隊發(fā)現(xiàn)了一款超級抗菌藥Drug X。
抗生素類藥物如今正面臨的一個很大的危機(jī)——抗生素耐藥性(AMR)。根據(jù)世界衛(wèi)生組織(WHO)的預(yù)測,到2050年,抗生素耐藥性將可能導(dǎo)致超過1000萬人死亡,超過癌癥導(dǎo)致的死亡人數(shù)。
有些藥物甚至在剛剛進(jìn)入臨床階段時,細(xì)菌就已對其產(chǎn)生了耐受。因此,找到能夠?qū)鼓退幘目股厥欠浅>o要的任務(wù)。
劉冰教授借助華為云盤古藥物分子大模型的分子優(yōu)化能力,有效地提升了小分子化合物與目標(biāo)抗菌靶點蛋白的結(jié)合、降低與人體蛋白的結(jié)合,從而減弱了Drug X對人體正常細(xì)胞可能產(chǎn)生的毒副作用。
同時,Drug X的靶點特質(zhì)決定了細(xì)菌將難以對其產(chǎn)生耐藥性,這一發(fā)現(xiàn)對抗瘧(即瘧原蟲)藥物研發(fā)等多個領(lǐng)域有著重要的影響。Drug X可能會成為全球近40年來首個新靶點、新類別的抗生素。
目前,這款藥物正處于臨床前階段,已經(jīng)進(jìn)行動物實驗驗證,在推進(jìn)IND申報中,并且已在國際范圍申請專利。
在人體器官芯片領(lǐng)域,我們與江蘇運動健康研究院院長、東南大學(xué)生物科學(xué)與醫(yī)學(xué)工程學(xué)院院長顧忠澤教授達(dá)成了合作。
顧忠澤教授團(tuán)隊是國內(nèi)最早一批開展人體器官芯片研究的團(tuán)隊,成功構(gòu)建了腫瘤、皮膚、心臟、血管等多種器官芯片,在部分研究領(lǐng)域中領(lǐng)先于國際水平。
2022年12月底,F(xiàn)DA不再要求人體臨床試驗前必須進(jìn)行動物實驗,人體器官芯片將成為變革性的動物和臨床替代實驗技術(shù)。
顧忠澤教授將盤古藥物分子大模型與器官芯片進(jìn)行了融合,利用盤古藥物分子大模型打通干濕實驗循環(huán),通過器官芯片獲取更加精準(zhǔn)的實驗數(shù)據(jù),從而提升臨床試驗的成功率。
在中樞神經(jīng)系統(tǒng)創(chuàng)新藥物的研發(fā)上,蘇州旺山旺水生物醫(yī)藥股份有限公司利用盤古輔助制藥平臺取得了很好的進(jìn)展。
中樞神經(jīng)系統(tǒng)的不可再生性是藥物研發(fā)中面臨的一大難題,此外,中樞神經(jīng)系統(tǒng)相關(guān)疾病的病例機(jī)制復(fù)雜、病程過長等特點,導(dǎo)致藥物實驗的周期過長。
為提升研發(fā)效率,旺山旺水公司借助我們的盤古輔助制藥平臺,覆蓋藥物研發(fā)干實驗的三大核心環(huán)節(jié),“靶點發(fā)現(xiàn)和藥效驗證、化合物屬性預(yù)測、化合物分子優(yōu)化設(shè)計”,使藥物設(shè)計效率提升了3倍,為分子設(shè)計實驗節(jié)省了60%以上的時間、資金成本。
在這些的合作過程中,我們對BT與AI深度融合的理解逐漸加深,同時客戶也為我們提出了產(chǎn)品改進(jìn)的建議,我們進(jìn)行評估后,及時更新到產(chǎn)品的迭代中,進(jìn)一步完善AI輔助藥物設(shè)計平臺。
《醫(yī)健AI掘金志》:AI制藥技術(shù)可將先導(dǎo)藥物研發(fā)周期大幅縮短,雖然已經(jīng)有少數(shù)藥物進(jìn)入臨床階段,但到目前為止,AI驅(qū)動研發(fā)的藥物仍然沒有一款成功獲批上市,AI技術(shù)研發(fā)的藥物距離上市還有多遠(yuǎn)?
喬楠:AIDD為藥物設(shè)計的效率和準(zhǔn)確性帶來了極大的提升,更重要的是使用起來非常方便,降低了藥物設(shè)計的門檻,即便是沒有化學(xué)背景的研發(fā)人員,經(jīng)過簡單的培訓(xùn)后,都可以借助AI輔助藥物設(shè)計平臺來做藥物設(shè)計。
很多創(chuàng)業(yè)公司也已經(jīng)開發(fā)了AI輔助藥物設(shè)計的工具和算法,這些工具的效果和價值已經(jīng)經(jīng)過了驗證。
藥物研發(fā)本身就有一定的周期,并且成功率一直都不算高,正常來說研發(fā)一款藥物的成功率只有10%,Al工具一定程度上能夠加速研發(fā)流程,提高成功率,但是距離AI輔助設(shè)計的藥物真正上市,還要再等一段時間。
如今這個行業(yè)需要解決的問題,一是對藥企的研發(fā)人員進(jìn)行培訓(xùn),讓他們都能掌握借助AI工具進(jìn)行藥物設(shè)計的方法,提升藥物研發(fā)的效率。
關(guān)于GAIR全球人工智能與機(jī)器人大會
“全球人工智能與機(jī)器人大會”(GAIR)始于2016年雷峰網(wǎng)(公眾號:雷峰網(wǎng))與中國計算機(jī)學(xué)會(CCF)合作創(chuàng)立的CCF-GAIR大會,由鵬城實驗室主任高文院士、香港中文大學(xué)(深圳)校長徐揚生院士、GAIR研究院創(chuàng)始人朱曉蕊、雷峰網(wǎng)創(chuàng)始人林軍等人聯(lián)合發(fā)起,旨在打造人工智能浪潮下,連接學(xué)術(shù)界、產(chǎn)業(yè)界、投資界的新平臺,而雷峰網(wǎng)“連接三界”的全新定位也在此大會上得以確立。歷屆大會邀請了多位圖靈獎、諾貝爾獎得主、40位院士、30位人工智能國際頂會主席、 100多位 Fellow,同時也有500多位知名企業(yè)領(lǐng)袖,是亞洲最具國際影響力的AI論壇之一。
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