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2020年10月26日,第十五屆國際基因組學大會(ICG-15)在武漢拉開帷幕。深圳華大智造科技股份有限公司(下稱“華大智造”)在學術報告中分享了“大人群基因組學一站式解決方案”。
該方案集樣本前處理、文庫制備、高通量測序、基因數(shù)據(jù)管理等模塊為一體,
華大智造高級副總裁倪鳴表示:“可以看到,近年來大人群基因組測序和分析漸成趨勢,國家級別的基因組測序項目不斷涌現(xiàn)。全球范圍內大人群基因組計劃的實施,對高通量基因測序平臺技術的水平,對基因測序方案的通量、成本、精準度、智能化等提出了更高要求?!?/p>
華大智造高級副總裁倪鳴在ICG-15分享解決方案
華大智造在大會上分享的“大人群基因組學一站式解決方案”由生物樣本庫、建庫中心、測序中心和數(shù)據(jù)中心四大核心模塊構成,可滿足每年五萬到百萬級規(guī)模高深度全基因組測序需求。
生物樣本庫主要功能是將全血分離為血漿和白膜層,完成gDNA提?。唤◣熘行膭t分為文庫制備和DNB制備兩部分,用于測序文庫制備。
大人群基因組學一站式解決方案布局
該方案的測序中心采用了定制測序系統(tǒng)——DNBSEQ-T10×4RS,這是基于華大智造DNBSEQ測序技術打造的高通量測序儀,滿足超高通量測序需求。
該測序系統(tǒng)的突破點在于,不同以往華大智造測序平臺采用流道式芯片和封閉式反應系統(tǒng),DNBSEQ-T10×4RS運用浸沒式生化方案和開放式反應體系,實現(xiàn)測序讀長、測序質量以及成本投入之間的平衡。
一臺DNBSEQ-T10×4RS測序系統(tǒng)支持8張測序載片同時運行,每天可產出最高達20Tb(約200個高深度人類全基因組)測序數(shù)據(jù),單套測序系統(tǒng)年產超過5萬個高深度個人全基因組測序。
采用該解決方案的前期測試數(shù)據(jù)顯示, DNBSEQ-T10×4RS測序系統(tǒng)檢測SNP準確度和靈敏度都超過99%,檢測Indel準確度和靈敏度超過98%。
運行中的DNBSEQ-T10 × 4RS
最后一個重要模塊——數(shù)據(jù)中心,使用華大智造ZTRON基因數(shù)據(jù)中心一體機,實現(xiàn)樣本管理、實驗室生產、生信分析及數(shù)據(jù)治理等全周期基因數(shù)據(jù)管理。
ZTRON基因數(shù)據(jù)中心一體機
近兩年,華大智造憑借高通量測序整體解決方案及全流程運轉能力,不斷拓展高通量測序技術的創(chuàng)新應用能力。
2019年9月,由華大智造自主研發(fā)的超高通量基因測序儀DNBSEQ-T7正式交付商用。作為全球日生產能力最強的基因測序儀,DNBSEQ-T7配備4聯(lián)載片平臺,四載片連載日產數(shù)據(jù)量高達6Tb,即一天最多可完成60例個人全基因組測序,是能夠有力推動測序產業(yè)躍遷的“超級生命計算機”。
同年12月,阿聯(lián)酋啟動 “全民基因組計劃”,其中華大智造負責建設高通量測序平臺,為該計劃提供設備支撐。
當前,大規(guī)模人群基因組學研究項目成果正在全球范圍內持續(xù)拓展,包括美國、新加坡、法國、阿聯(lián)酋在內的多國政府先后啟動國家級大人群基因組計劃。
不久前,英國政府頒布了全國性基因組學醫(yī)療保健戰(zhàn)略——《基因組英國(Genome UK)》,將在未來持續(xù)利用基因組學對特定患者群體進行干預,以應對新的全球性流行病和公共衛(wèi)生威脅,生命科學產業(yè)進入基因大數(shù)據(jù)時代。雷鋒網雷鋒網雷鋒網
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